RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 NKX2-2O95096 273 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 GADD45GO95257 159 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 TNFAIP8O95379 198 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SNAP29O95721 258 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CBX7O95931 251 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 LYNP07948 512 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CT62P0C5K7 136 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ACP2P11117 423 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 TNFRSF1BP20333 461 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MAOAP21397 527 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PRKAR1BP31321 381 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 YAP1P46937 504 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS6KA3P51812 740 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CDH12P55289 794 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 DCDP81605 110 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SPIBQ01892 262 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 FUT7Q11130 342 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 NSDHLQ15738 373 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MICAQ29983 383 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP27C1Q4G0S4 372 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 COLEC12Q5KU26 742 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 AP1ARQ63HQ0 302 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PRR23CQ6ZRP0 262 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1R3BQ86XI6 285 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM151BQ8IW70 566 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 TAGAPQ8N103 731 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 AGBL5Q8NDL9 886 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 RCBTB1Q8NDN9 531 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PIK3C3Q8NEB9 887 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 OR52P1PQ8NH57 321 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CLIP3Q96DZ5 547 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SDF2Q99470 211 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CNPPD1Q9BV87 410 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 TGIF2Q9GZN2 237 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF556Q9HAH1 456 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 LANCL2Q9NS86 450 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PNPLA3Q9NST1 481 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 KIF17Q9P2E2 1029 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ENOPH1Q9UHY7 261 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 TESMINQ9Y4I5 508 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PI4KAP42356 2102 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 UNC13CQ8NB66 2214 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIOO75962 3097 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 EML5Q05BV3 1969 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 C17orf105B2RV13 164 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 D6RAR5 112 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 DLGAP1O14490 977 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 FCMRO60667 390 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 JRKO75564 520 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SCRG1O75711 98 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 DBIP07108 87 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 GUSBP08236 651 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 MYF6P23409 242 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 IGFBP5P24593 272 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SOX18P35713 384 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 MAP3K8P41279 467 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 EMDP50402 254 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 PGDP52209 483 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 PDX1P52945 283 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 FUT5Q11128 374 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 DUSP8Q13202 625 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 BLMHQ13867 455 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 EIPR1Q53HC9 387 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 DCST2Q5T1A1 773 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 C1orf189Q5VU69 101 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 KDM4DQ6B0I6 523 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TCTN3Q6NUS6 607 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM154Q6P9G4 183 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 UGT2A3Q6UWM9 527 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 DEF8Q6ZN54 512 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 HS3ST5Q8IZT8 346 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SHISA5Q8N114 240 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF619Q8N2I2 560 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00471Q8N535 108 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SIMC1Q8NDZ2 872 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 PLPP5Q8NEB5 264 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR32P1Q8NGA4 272 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 OR52J3Q8NH60 311 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 DOK4Q8TEW6 326 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms