RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa20.52■□□□□ 0.88
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HOXD4-201ENST00000306324 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 SVILO95425 2214 aa20.52■□□□□ 0.87
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HOXD4-201ENST00000306324 CLIC1O00299 241 aa20.51■□□□□ 0.87
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HOXD4-201ENST00000306324 COX20Q5RI15 118 aa20.51■□□□□ 0.87
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HOXD4-201ENST00000306324 KIR3DP1A8MWS1 328 aa20.5■□□□□ 0.87
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HOXD4-201ENST00000306324 CRATP43155 626 aa20.5■□□□□ 0.87
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HOXD4-201ENST00000306324 DCST2Q5T1A1 773 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 ATAD3BQ5T9A4 648 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 REP15Q6BDI9 236 aa20.5■□□□□ 0.87
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HOXD4-201ENST00000306324 C16orf62Q7Z3J2 963 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 TREML1Q86YW5 311 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 MSRB3Q8IXL7 192 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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HOXD4-201ENST00000306324 AGR2O95994 175 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 COX4I1P13073 169 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 DNASE1L1P49184 302 aa20.5■□□□□ 0.87
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HOXD4-201ENST00000306324 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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HOXD4-201ENST00000306324 DOHHQ9BU89 302 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 HMGN4O00479 90 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 ATP6V1C1P21283 382 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 RFC3P40938 356 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 CASP3P42574 277 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 MVDP53602 400 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 MLLT10P55197 1068 aa20.49■□□□□ 0.87
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HOXD4-201ENST00000306324 FLRT3Q9NZU0 649 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 NCKAP5O14513 1909 aa20.49■□□□□ 0.87
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HOXD4-201ENST00000306324 PINLYPA6NC86 204 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 PRAMEF25A6NGN4 478 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 B8ZZF3 427 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 SUV39H1O43463 412 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 UTS2O95399 124 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 AK1P00568 194 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 ETFAP13804 333 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 PPIBP23284 216 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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HOXD4-201ENST00000306324 TBCELQ5QJ74 424 aa20.48■□□□□ 0.87
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