RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296786.7

UBLCP1-201, Transcript of ubiquitin like domain containing CTD phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBLCP1, Length 2,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1-201ENST00000296786 ANKMY1Q9P2S6 941 aa8.7□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.7□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 A0A0C4DFX4 3053 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 LAMA1P25391 3075 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 DNAJB6O75190 326 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 SNX4O95219 450 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 RASGRP1O95267 797 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 CH25HO95992 272 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 THY1P04216 161 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 GNSP15586 552 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 IFNA8P32881 189 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 ACSL1P33121 698 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 GPR4P46093 362 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 MTNR1AP48039 350 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 RORCP51449 518 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 MXD1Q05195 221 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 RUNX2Q13950 521 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 KIR2DS3Q14952 304 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 TMEM31Q5JXX7 168 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 SLC30A6Q6NXT4 461 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 SHFQ7M4L6 423 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 OR4K14Q8NGD5 310 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 OR10G6Q8NH81 332 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 TM9SF4Q92544 642 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 PIK3R3Q92569 461 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 TMEM203Q969S6 136 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 BMFQ96LC9 184 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 SLC38A2Q96QD8 506 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 SERINC2Q96SA4 455 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 MCHR1Q99705 422 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 KLHL25Q9H0H3 589 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 ANKRD19PQ9H560 264 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 RERGLQ9H628 205 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 C14orf119Q9NWQ9 140 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 NTMQ9P121 344 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 PHF11Q9UIL8 331 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 DAPP1Q9UN19 280 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 WDR45Q9Y484 360 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 MYO15AQ9UKN7 3530 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 TMEM129A0AVI4 362 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 GSAPA4D1B5 854 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 SNTNA6NMZ2 147 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 PLD2O14939 933 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 PIP5K1CO60331 668 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 SMIM10L1P0DMW3 83 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 UGT2B7P16662 529 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 PTNP21246 168 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 CTHP32929 405 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 BNC1Q01954 994 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 CARTPTQ16568 116 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 DUSP5Q16690 384 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 DECR1Q16698 335 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 MINDY4Q4G0A6 757 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 FCRL6Q6DN72 434 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 DESI1Q6ICB0 168 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 ZNF836Q6ZNA1 936 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 GDF7Q7Z4P5 450 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 LAX1Q8IWV1 398 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 NRMQ8IXM6 262 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 OR2L13Q8N349 312 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 FLCNQ8NFG4 579 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 GPR151Q8TDV0 419 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 TMEM255BQ8WV15 326 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 ASB12Q8WXK4 309 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 SLC41A3Q96GZ6 507 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 SMIM10Q96HG1 83 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 PRRG3Q9BZD7 231 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 SCML1Q9UN30 329 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 MPDZO75970 2070 aa8.69□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa8.68□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa8.68□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa8.68□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 IRGMA1A4Y4 181 aa8.68□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 A6NCN8 305 aa8.68□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 ZNF860A6NHJ4 632 aa8.68□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 LRRTM2O43300 516 aa8.68□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 TNFSF14O43557 240 aa8.68□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 B3GALT2O43825 422 aa8.68□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 CDRT1O95170 752 aa8.68□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 AGR2O95994 175 aa8.68□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 TSPAN19P0C672 248 aa8.68□□□□□ -1.02
UBLCP1-201ENST00000296786 FPR3P25089 353 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms