RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237247.10

SGIP1-201, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-201ENST00000237247 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
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SGIP1-201ENST00000237247 TMEM161AQ9NX61 479 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 TMEM129A0AVI4 362 aa5.93□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 PRAMEF25A6NGN4 478 aa5.93□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 C5orf52A6NGY3 159 aa5.93□□□□□ -1.46
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SGIP1-201ENST00000237247 C1DQ13901 141 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 CDNFQ49AH0 187 aa5.93□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 FLYWCH1Q4VC44 716 aa5.93□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 HACD4Q5VWC8 232 aa5.93□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa5.93□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 QSOX2Q6ZRP7 698 aa5.93□□□□□ -1.46
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