RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC103Q8IW40 242 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 CARFQ8N187 725 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 PRR14Q9BWN1 585 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 FITM1A5D6W6 292 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 H0YIG0 161 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 HRO43593 1189 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 SOX30O94993 753 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 IFNGR2P38484 337 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 GPR3P46089 330 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 COX10Q12887 443 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 SNAP47Q5SQN1 464 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 PTCHD4Q6ZW05 846 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 RRM2BQ7LG56 351 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 OR51Q1Q8NH59 317 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 FKBP10Q96AY3 582 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 COPS4Q9BT78 406 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 H3BMQ9 156 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 OR2B3O76000 313 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 TMBIM6P55061 237 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 GPLD1P80108 840 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 ENTPD8Q5MY95 495 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 FIGNL1Q6PIW4 674 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 MORN4Q8NDC4 146 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 FAR1Q8WVX9 515 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 MYDGFQ969H8 173 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 COG8Q96MW5 612 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 DOK1Q99704 481 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 MCHR1Q99705 422 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 M0R129 80 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 INMTO95050 263 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 FADS2O95864 444 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 ATXN8OSP0DMR3 200 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 MMP11P24347 488 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 HOXC5Q00444 222 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 MVKQ03426 396 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 MAMSTRQ6ZN01 415 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 DIO2Q92813 273 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 SAP130Q9H0E3 1048 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 ANKRD19PQ9H560 264 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC24A3Q9HC58 644 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 SEMA4GQ9NTN9 838 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa22.28■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 CLDN24A6NM45 220 aa22.28■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM150CB9EJG8 249 aa22.28■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 KIAA0513O60268 411 aa22.28■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 GABRB1P18505 474 aa22.28■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 CD1CP29017 333 aa22.28■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 MAP3K8P41279 467 aa22.28■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 MAP2K4P45985 399 aa22.28■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 EMP3P54852 163 aa22.28■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 HSD17B7P56937 341 aa22.28■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 BTG2P78543 158 aa22.28■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 C1orf94Q6P1W5 598 aa22.28■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 CASP12Q6UXS9 341 aa22.28■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF730Q6ZMV8 503 aa22.28■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 ZER1Q7Z7L7 766 aa22.28■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 ARMC7Q9H6L4 198 aa22.28■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 AMBNQ9NP70 447 aa22.28■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 CUTCQ9NTM9 273 aa22.28■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 CLN6Q9NWW5 311 aa22.28■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa22.28■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 CLCA1A8K7I4 914 aa22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 TGFBR3LH3BV60 316 aa22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 NKX2-2O95096 273 aa22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 TNNI3P19429 210 aa22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 GSTM3P21266 225 aa22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 MAOAP21397 527 aa22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 HOXA6P31267 233 aa22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 NUDT6P53370 316 aa22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 CD300LDQ6UXZ3 194 aa22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 RAB2BQ8WUD1 216 aa22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 PMM1Q92871 262 aa22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 FOLH1BQ9HBA9 442 aa22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 POLE3Q9NRF9 147 aa22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 NDOR1Q9UHB4 597 aa22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 LAMA1P25391 3075 aa22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 A0A087WUU8 490 aa22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 GXYLT2A0PJZ3 443 aa22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF749O43361 778 aa22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 NID1P14543 1247 aa22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 RFX3P48380 749 aa22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 TTLL10Q6ZVT0 673 aa22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 YIPF2Q9BWQ6 316 aa22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 FBXO34Q9NWN3 711 aa22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 MAU2Q9Y6X3 613 aa22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms