RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr684Q7TRN8 312 aa17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q810M1 233 aa17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sdr9c7Q8K3P0 313 aa17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Irak4Q8R4K2 459 aa17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr935Q8VG16 308 aa17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dus3lQ91XI1 637 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tas2r103Q9JKA3 312 aa17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lmx1aQ9JKU8 382 aa17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Exo1Q9QZ11 837 aa17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Enpp2Q9R1E6 862 aa17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PrkraQ9WTX2 313 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Adam34A2RSG8 714 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 2610021A01RikE9Q0Q3 834 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr605E9Q838 314 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm6619F6URP1 175 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm21319F6YNI8 144 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn2r52L7N2B2 852 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ncam1P13595 1115 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gsta1P13745 223 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ido1P28776 407 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bmp1P98063 991 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmprss11cQ1JRP2 431 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kcnk9Q3LS21 402 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dcp1bQ3U564 578 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Garem1Q3UFT3 876 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccser2Q3UHI0 833 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sgk494Q5SYL1 278 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam169aQ5XG69 665 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SpicQ6P3D7 242 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gsta1Q6P8Q0 223 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tas2r117Q7M715 330 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm42417Q8K1D0 126 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gpr18Q8K1Z6 331 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr881Q8VF63 314 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mat1aQ91X83 396 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pex16Q91XC9 336 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rnf167Q91XF4 347 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc25a46Q9CQS4 418 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gadd45gip1Q9CR59 222 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 C1qtnf2Q9D8U4 294 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pbld1Q9DCG6 288 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ntn4Q9JI33 628 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pla2g2fQ9QZT4 168 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Spo11Q9WTK8 396 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Itgb6Q9Z0T9 787 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pmm2Q9Z2M7 242 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Chil5A0A0G2JDS2 431 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp937A2ANU7 503 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tgm7A2ART8 616 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 8030474K03RikE9Q4Y8 554 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr171G5E8J1 314 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CyctP00015 105 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 C4bpaP08607 469 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 FstP47931 344 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 TstP52196 297 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prss55Q14BX2 321 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Polr2mQ6P6I6 366 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mterf4Q8BVN4 346 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Chpt1Q8C025 398 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Endod1Q8C522 501 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc22a6Q8VC69 545 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NclnQ8VCM8 563 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PpcsQ8VDG5 311 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mrm1Q99J25 320 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cxxc1Q9CWW7 660 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Izumo1rQ9EQF4 244 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ulk2Q9QY01 1037 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bex2Q9WTZ8 129 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dctn3Q9Z0Y1 186 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 5430403G16RikD3Z5L4 667 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tex264E9Q137 309 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 AurkcO88445 282 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mtnd1P03888 318 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hoxb6P09023 224 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hoxb3P09026 433 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pcp2P12660 120 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 FurinP23188 793 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ntsr2P70310 416 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Csf2raQ00941 388 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kdm4dQ3U2K5 510 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Spata13Q5DU57 656 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PfplQ5RKV8 702 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q8BHB7 409 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Banf2Q8BVR0 90 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Oas3Q8VI93 1138 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Klhl22Q99JN2 634 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Phf6Q9D4J7 364 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tvp23bQ9D8T4 205 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp981A2A8V7 445 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Skint8A7XV07 398 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kif1cO35071 1100 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp1P08042 402 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp37P17141 594 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bpifa1P97361 278 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pitx2P97474 317 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Myl12bQ3THE2 172 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cramp1Q6PG95 1285 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Acsm4Q80W40 580 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Klhl42Q8BFQ9 493 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lrrc39Q8BGI7 337 aa17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.2 ms