RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000032487.13

Vamp1-201, Transcript of Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vamp1, Length 2,772 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vmn1r74Q8R290 304 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tmprss4Q8VCA5 435 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr1317Q8VF84 316 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Lpcat3Q91V01 487 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 MINDY3Q9CV28 444 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 FopnlQ9CZS3 174 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rpl34Q9D1R9 117 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tmem86aQ9D8N3 241 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Sult1c2Q9D939 296 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr711Q9EPG2 314 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr27Q9EQ90 311 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Nqo2Q9JI75 231 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 D7h11orf16Q9JJR6 402 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Stk25Q9Z2W1 426 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Trbv23A0A0A6YWQ1 115 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Nkx6-2D3Z4R4 277 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Acbd4E9Q289 327 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mex3aG3UYU0 520 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vmn2r69G3XA45 850 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm20683H3BKJ1 410 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Stc1O55183 247 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Kcnj15O88932 375 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 JchainP01592 159 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 H2-T23P06339 357 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zfp28P10078 825 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cd63P41731 238 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Sat1P48026 171 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 SnrpgP62309 76 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 QrfprP83861 433 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 UbqlnlQ14DL0 610 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rnf149Q3U2C5 394 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Garem1Q3UFT3 876 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 SrmQ64674 302 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rad9bQ6WBX7 403 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 PisdQ8BSF4 406 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Bpifb2Q8C1E1 462 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 4921517D22RikQ8CET0 269 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tceal3Q8R0A5 200 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 TapbplQ8VD31 451 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr1217Q8VGG1 304 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zcchc14Q8VIG0 956 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Dmbx1Q91ZK4 381 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 FcrlaQ920A9 352 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Spred2Q924S7 410 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tmem33Q9CR67 247 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cpn2Q9DBB9 547 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Oasl2Q9Z2F2 508 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ralgps1A2AR50 585 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ldlrad3A2AR95 345 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 CatsperdE9Q9F6 805 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 H2-M11F6U8V3 335 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cldn34aG3UW52 211 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vmn2r86G5E8Y4 848 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 PbsnO08976 174 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Neurod4O09105 330 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Wsb2O54929 404 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cacng1O70578 223 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Il1r1P13504 576 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pou3f1P21952 449 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 FaslgP41047 279 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Fgf9P54130 208 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 DmwdQ08274 665 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ankrd53Q3V0J4 497 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 HepacamQ640R3 418 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Fam189a1Q6A044 515 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cbln2Q8BGU2 224 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Peli2Q8BST6 419 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Isoc2bQ9DCC7 210 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gpr88Q9EPB7 384 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Prokr1Q9JKL1 393 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gk2Q9WU65 554 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cited4Q9WUL8 182 aa10.99□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm45736A0A1B0GS18 427 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gpr155A2AWR3 868 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zfp758E9QAA1 583 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rnf165E9QAU8 347 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc38a6G3UVW3 457 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tex54G3UW99 86 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Calhm3J3QMI4 347 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 P06324 132 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 NfyaP23708 346 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Bmi1P25916 324 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Hsd3b3P26150 373 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mmp3P28862 477 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 RoraP51448 523 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cxcr4P70658 359 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 DbpQ60925 325 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Znf354aQ61751 572 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr855Q7TRF8 312 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Nudt15Q8BG93 170 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Stx19Q8R1Q0 292 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 DutQ8VCG1 200 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 MiosQ8VE19 875 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Sntb1Q99L88 537 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pop4Q9CR08 221 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Stx11Q9D3G5 287 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gbf1Q6DFZ1 1861 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr239A0PK55 315 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Dpy19l1A6X919 746 aa10.98□□□□□ -0.65
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pgbd5D3YZI9 523 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46 ms