RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cd300cA2A7V7 229 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TprnA2AI08 749 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r16K7N775 303 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r52L7N2B2 852 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NgpO08692 167 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc22a1O08966 556 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bcl2a1dO55179 172 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 P01635 115 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cst3P21460 140 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nckap1P28660 1128 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sox14Q04892 240 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 LvrnQ2KHK3 559 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccbe1Q3MI99 408 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ankrd27Q3UMR0 1048 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Clec4a4Q5YIR8 236 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vdac3Q60931 283 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Serpinf2Q61247 491 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SpicQ6P3D7 242 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Acsm4Q80W40 580 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Atg4dQ8BGV9 474 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prox2Q8BII1 593 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kcnmb1Q8CAE3 191 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Yod1Q8CB27 343 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Foxe1Q8R2I0 371 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ntng1Q8R4G0 539 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1467Q8VFW1 308 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc15a4Q91W98 574 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Popdc3Q9ES81 291 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 A0A286YDU1 74 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cd300ld4A2A7W1 245 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pgbd5D3YZI9 523 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm17019K7N6W5 255 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm8374L7N2A9 172 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pias3O54714 628 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Asna1O54984 348 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dsg2O55111 1122 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hnrnpa2b1O88569 353 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 P01735 133 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 GlulP15105 373 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Actr1aP61164 376 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hyal4Q05A56 481 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Agbl4Q09LZ8 540 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ptchd1Q14B62 888 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hddc2Q3SXD3 199 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mup20Q5FW60 181 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cd300ld3Q6SJQ5 245 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Myl12aQ6ZWQ9 172 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pgr15lQ80T54 456 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ap4e1Q80V94 1122 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trmt12Q8BG71 446 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Wbp1lQ8BGW2 348 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sdhaf3Q8BQU3 125 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cmtr2Q8BWQ4 767 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znf322Q8BZ89 410 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zbtb20Q8K0L9 741 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Actr1bQ8R5C5 376 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Oas3Q8VI93 1138 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Akr1c21Q91WR5 323 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mrpl54Q9CPW3 135 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem179bQ9CY24 219 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ift27Q9D0P8 186 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Htra3Q9D236 459 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tex19.2Q9D5S1 317 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tex47Q9D5W8 253 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RgccQ9DBX1 137 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rtp4Q9ER80 249 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lbx2Q9WUN8 195 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ankrd12G5E893 2041 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 HelzQ6DFV5 1964 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lrp4Q8VI56 1905 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Chil5A0A0G2JDS2 431 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cela3aA2A9U8 283 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AgmatA2AS89 358 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SvaE9PX96 165 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r105E9Q3A5 860 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lsm2O35900 95 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Amd1P0DMN7 334 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 OtcP11725 354 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Atp1b1P14094 304 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Srp54P14576 504 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ntrk2P15209 821 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 DbtP53395 482 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lrpap1P55302 360 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fbxo40P62932 710 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 P2rx5Q3UYI1 455 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Grhl3Q5FWH3 603 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bod1Q5SQY2 173 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mef2aQ60929 498 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Runx1t1Q61909 577 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem164Q6PHN7 296 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Thoc7Q7TMY4 204 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr406Q7TRX0 323 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slitrk5Q810B7 957 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Glt28d2Q8BML3 165 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm9938Q8C3P5 112 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nt5dc1Q8C5P5 467 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Casc3Q8K3W3 698 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RbksQ8R1Q9 323 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trim16Q99PP9 556 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Exo1Q9QZ11 837 aa9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.6 ms