RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	FNIP2	Q9P278	1114 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	SPTBN2	O15020	2390 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	TTLL8	A6PVC2	850 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624		E7EQ34	232 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	GOSR2	O14653	212 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	PRODH	O43272	600 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	HLA-DQA2	P01906	255 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	TPO	P07202	933 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	FOSL2	P15408	326 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	AMD1	P17707	334 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	EDNRA	P25101	427 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	GCGR	P47871	477 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	SOX2	P48431	317 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	SKP1	P63208	163 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	SLC14A1	Q13336	389 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	HTR4	Q13639	388 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	NME7	Q9Y5B8	376 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624		A0A1W2PRQ8	180 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	ANHX	E9PGG2	379 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	PPM1B	O75688	479 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	IFNG	P01579	166 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	11.49	□□□□□ -0.57	9e-7	■■■■□ 22.3
PXN-222	ENST00000637624	GPR4	P46093	362 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	AP1S2	P56377	157 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	TNFRSF17	Q02223	184 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	NTMT1	Q9BV86	223 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	ABCG4	Q9H172	646 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	T	O15178	435 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	PEX14	O75381	377 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	CD2	P06729	351 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	ACADM	P11310	421 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	SRC	P12931	536 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	GABRB1	P18505	474 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	S100A2	P29034	98 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	OR12D2	P58182	307 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	SLC14A2	Q15849	920 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	SSX1	Q16384	188 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	CD276	Q5ZPR3	534 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	LIPI	Q6XZB0	460 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	TMEM163	Q8TC26	289 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	FANK1	Q8TC84	345 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	PFDN5	Q99471	154 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	PITX2	Q99697	317 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	CRB3	Q9BUF7	120 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	RHBG	Q9H310	441 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	SHOX	O15266	292 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	FZD7	O75084	574 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	IGHA2	P01877	340 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	IFNA6	P05013	189 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	OR12D1	P0DN82	309 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	ELK1	P19419	428 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	ADH7	P40394	386 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	BDKRB1	P46663	353 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	HBA1	P69905	142 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	CLLU1	Q5K131	121 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	CPA6	Q8N4T0	437 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	NANP	Q8TBE9	248 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	TTC9	Q92623	222 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	C5AR2	Q9P296	337 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	PPT2	Q9UMR5	302 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	KRT33A	O76009	404 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	TGM6	O95932	706 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	SHC1	P29353	583 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	GABRA5	P31644	462 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	ZNF79	Q15937	498 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	GPR33	Q49SQ1	333 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	HES5	Q5TA89	166 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	GPR135	Q8IZ08	494 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	LINC00052	Q96N35	136 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PXN-222	ENST00000637624	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57

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