RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636254.1

ARID1B-215, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5

Gene ARID1B, Length 3,848 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-215	ENST00000636254	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	HSPB11	Q9Y547	144 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	OR10H2	O60403	315 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	SOX30	O94993	753 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	EFEMP2	O95967	443 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	CD160	O95971	181 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	IGLV3-27	P01718	113 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	PSKH1	P11801	424 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	IDS	P22304	550 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	DCK	P27707	260 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	IMPA1	P29218	277 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	PBX2	P40425	430 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	FBXW4	P57775	412 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	TGM3	Q08188	693 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	GALE	Q14376	348 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	ZNF691	Q5VV52	312 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	OXR1	Q8N573	874 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	PIGK	Q92643	395 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	MSANTD3	Q96H12	275 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	LRR1	Q96L50	414 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	RDH12	Q96NR8	316 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	MBOAT4	Q96T53	435 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	CNIH4	Q9P003	139 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	DLGAP1	O14490	977 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	KLHL18	O94889	574 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	ALX3	O95076	343 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	DHFR	P00374	187 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	PTH	P01270	115 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	LAMP2	P13473	410 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	CBL	P22681	906 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	BMI1	P35226	326 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	BMPR1A	P36894	532 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	TGM4	P49221	684 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	CCR8	P51685	355 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	B4GALNT1	Q00973	533 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	ZNF45	Q02386	682 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	SLC9A5	Q14940	896 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	DUSP7	Q16829	419 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	ARL9	Q6T311	187 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	OOSP2	Q86WS3	158 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	SLC43A2	Q8N370	569 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	WDR26	Q9H7D7	661 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	RNF24	Q9Y225	148 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	LTBP2	Q14767	1821 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	LINC00587	B1AMM8	73 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	PRAMEF10	O60809	474 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	ENTPD6	O75354	484 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	ZNF30	P17039	623 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	CCR2	P41597	374 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	SOX9	P48436	509 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	STAR	P49675	285 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	CASP6	P55212	293 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	PFN3	P60673	137 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	SELENOW	P63302	87 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	MVK	Q03426	396 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	CHAF1B	Q13112	559 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	SYPL1	Q16563	259 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	ODF4	Q2M2E3	257 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	ALG11	Q2TAA5	492 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	DEFB134	Q4QY38	66 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	IDNK	Q5T6J7	187 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	TMEM107	Q6UX40	140 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	OR51A7	Q8NH64	312 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	DTD1	Q8TEA8	209 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-215	ENST00000636254	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		7.46	□□□□□ -1.21

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