RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-215ENST00000624145 F6UZH7 168 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 H7BY64 318 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 J3QR89 54 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 DVL2O14641 736 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 AGPAT2O15120 278 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 CNTN5O94779 1100 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 SNAPINO95295 136 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 MMP2P08253 660 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 BCKDHBP21953 392 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 DNAJB1P25685 340 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 IL3RAP26951 378 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 IL2RGP31785 369 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 MC3RP41968 323 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 STK19P49842 368 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 AKR1C1Q04828 323 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 CATR1Q13166 79 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 APOFQ13790 326 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 TAF9Q16594 264 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 METTL11BQ5VVY1 283 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 PLCXD3Q63HM9 321 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 TMEM107Q6UX40 140 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ASRGL1Q7L266 308 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ACBD7Q8N6N7 88 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 DMBX1Q8NFW5 382 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 CMTM2Q8TAZ6 248 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC7A13Q8TCU3 470 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 IL1F10Q8WWZ1 152 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 FKBP10Q96AY3 582 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 TEPSINQ96N21 525 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 PRAP1Q96NZ9 151 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 OBP2BQ9NPH6 170 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 DZANK1Q9NVP4 752 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 DTLQ9NZJ0 730 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 GALPQ9UBC7 116 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 WNT6Q9Y6F9 365 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 GLI2P10070 1586 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 B4DXG7 233 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 NPIPA7E9PJI5 369 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 PMM2O15305 246 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 DLX3O60479 287 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 DNAJB5O75953 348 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 RETP07949 1114 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 TFPTP0C1Z6 253 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 OR10J4P0C629 311 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 NPIPA8P0DM63 369 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ABOP16442 354 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 TBPP20226 339 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 GABRR1P24046 479 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 SNCAP37840 140 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 EFNA3P52797 238 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC14A1Q13336 389 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 TEAD2Q15562 447 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 NXPE4Q6UWF7 544 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 LCTLQ6UWM7 567 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 FBXW12Q6X9E4 464 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 OR8J1Q8NGP2 316 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 OR1J4Q8NGS1 313 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 NANPQ8TBE9 248 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 STT3BQ8TCJ2 826 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 LPAR4Q99677 370 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 PKP2Q99959 881 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 KCND1Q9NSA2 647 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC7A7Q9UM01 511 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 OR1A2Q9Y585 309 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 RCCD1A6NED2 376 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 NAP1L6A6NFF2 107 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 YJEFN3A6XGL0 299 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 NRP1O14786 923 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ARPC5O15511 151 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 TXNL1O43396 289 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 KDELR3O43731 214 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 KIAA0513O60268 411 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 RAB3DO95716 219 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 HPRP00739 348 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ITGB2P05107 769 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 AKAIN1P0CW23 69 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF44P15621 663 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 JUNDP17535 347 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 PRKACAP17612 351 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 IL32P24001 234 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 TACR3P29371 465 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 NR4A2P43354 598 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ATP4BP51164 291 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 DEFA6Q01524 100 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 GPR50Q13585 617 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 MEF2DQ14814 521 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 LAPTM4AQ15012 233 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 HES5Q5TA89 166 aa3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.6 ms