RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 PCYT1AP49585 367 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 PNLIPRP2P54317 469 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 B3GALT5-AS1P59052 145 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 RAE1P78406 368 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 SHEQ5VZ18 495 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 DCAKDQ8WVC6 231 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 FOLH1BQ9HBA9 442 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 ARID1AO14497 2285 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 PCDH7O60245 1069 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 CTAGE8P0CG41 777 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 IL12BP29460 328 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 CPOXP36551 454 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 FAM27E3Q08E93 113 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 RASA2Q15283 850 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 Q71RC1 249 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 CTAGE4Q8IX94 777 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 STARD4Q96DR4 205 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 C17orf51A8MQB3 221 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 PLOD3O60568 738 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 UNC50Q53HI1 259 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 OR2A2Q6IF42 318 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 P4HA3Q7Z4N8 544 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 OR4N2Q8NGD1 307 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 MTBPQ96DY7 904 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF382Q96SR6 550 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 ACPTQ9BZG2 426 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 ULK1O75385 1050 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 SUPT7LO94864 414 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 HEPACAMQ14CZ8 416 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF678Q5SXM1 525 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 TEX35Q5T0J7 233 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 CHMP1BQ7LBR1 199 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 FADS6Q8N9I5 356 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 OR7G2Q8NG99 324 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 OR4K17Q8NGC6 315 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 C16orf78Q8WTQ4 265 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 GIMAP4Q9NUV9 329 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 TAS2R9Q9NYW1 312 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 FN1P02751 2386 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 SLC22A20A6NK97 555 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 SIAH2O43255 324 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGEF9O43307 516 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 PEPDP12955 493 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 MPIP34949 423 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 MC3RP41968 323 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 CLDN15P56746 228 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 SPIN4Q56A73 249 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 VWA1Q6PCB0 445 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 CLEC9AQ6UXN8 241 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 BTLAQ7Z6A9 289 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 METTL6Q8TCB7 284 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 APIPQ96GX9 242 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 PIP5K1AQ99755 562 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 DSN1Q9H410 356 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 OR10H1Q9Y4A9 318 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 JMJD1CQ15652 2540 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 DEFB108AA8MXU0 73 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 TAC1P20366 129 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 EVI2BP34910 448 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 CD79BP40259 229 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 HTR6P50406 440 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 PSG6Q00889 435 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 ACSM2AQ08AH3 577 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 ACSM2BQ68CK6 577 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 GALNT18Q6P9A2 607 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 UBQLNLQ8IYU4 475 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 FAM9CQ8IZT9 166 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 OR2M3Q8NG83 312 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF592Q92610 1267 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 PGM2Q96G03 612 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM237Q96Q45 408 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 FMO2Q99518 471 aa22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms