RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DSPP15924 2871 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 G3V3Y1 287 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 K7EM74 188 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HMGN4O00479 90 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC28A2O43868 658 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IGKV1D-16P01601 117 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 T-ENOLP0DO92 83 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAN2A2P49641 1150 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MVDP53602 400 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KCNAB2Q13303 367 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SYPL1Q16563 259 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DECR1Q16698 335 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PIGGQ5H8A4 983 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GCNT6Q5T4J0 391 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DEFB107AQ8IZN7 70 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RNF148Q8N7C7 305 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR10A6Q8NH74 314 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NFKBIDQ8NI38 313 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TP53INP1Q96A56 240 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM125Q96AQ2 219 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HSPBAP1Q96EW2 488 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADOQ96SZ5 270 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STACQ99469 402 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ECSITQ9BQ95 431 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EXD2Q9NVH0 621 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FBXO34Q9NWN3 711 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 P2RX2Q9UBL9 471 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 USP22Q9UPT9 525 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CORO2BQ9UQ03 480 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CSAG2Q9Y5P2 127 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ACACBO00763 2458 aa13.41□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ACOX3O15254 700 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CEACAM4O75871 244 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KCNK2O95069 426 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PDGFAP04085 211 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ITGB2P05107 769 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NR2F1P10589 423 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ATP6V1C1P21283 382 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC6A2P23975 617 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMED10P49755 219 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MNAT1P51948 309 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SOX8P57073 446 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FUT5Q11128 374 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TUBA3CQ13748 450 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LINC00303Q3SY05 128 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 COLEC12Q5KU26 742 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TUBA3EQ6PEY2 450 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OPN5Q6U736 354 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C16orf89Q6UX73 402 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC121Q6ZUS5 278 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZAR1Q86SH2 424 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF614Q8N883 585 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ANKFN1Q8N957 763 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C17orf47Q8NEP4 570 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR10G3Q8NGC4 313 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR8J3Q8NGG0 315 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ABHD17AQ96GS6 310 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BTBD2Q9BX70 525 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MFRPQ9BY79 579 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KLHL1Q9NR64 748 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DUSP22Q9NRW4 184 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CMTM6Q9NX76 183 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FLRT3Q9NZU0 649 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LRFN1Q9P244 771 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM247A6NEH6 219 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TTC36A6NLP5 189 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DUXAA6NLW8 204 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C5orf58C9J3I9 102 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EBAG9O00559 213 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NME4O00746 187 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SCO2O43819 266 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HS6ST1O60243 411 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UGT2B11O75310 529 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PPM1BO75688 479 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AGR2O95994 175 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NPPAP01160 153 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FBXO45P0C2W1 286 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CYP4B1P13584 511 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AQP1P29972 269 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PIGAP37287 484 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAP3K8P41279 467 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CD97P48960 835 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FADDQ13158 208 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR1C1Q15619 314 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GPR68Q15743 365 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FLYWCH1Q4VC44 716 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRAMEF20Q5VT98 475 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C6orf89Q6UWU4 347 aa13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms