RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	EMB	Q6PCB8	327 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	TM9SF2	Q99805	663 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCT7	Q99832	543 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	CALHM2	Q9HA72	323 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	MKS1	Q9NXB0	559 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	STOML1	Q9UBI4	398 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	CBLC	Q9ULV8	474 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	SCO2	O43819	266 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	NPHS1	O60500	1241 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	TSPAN2	O60636	221 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	NUDT17	P0C025	328 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	LINC00032	P0C843	101 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRPS2	P11908	318 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	CPN1	P15169	458 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	HPGD	P15428	266 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	IGFBP2	P18065	325 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRPH2	P23942	346 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	CHM	P24386	653 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	CTSS	P25774	331 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	DPP4	P27487	766 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	EVI2B	P34910	448 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	SERPINB5	P36952	375 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	CPA2	P48052	419 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	TFF3	Q07654	80 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	HSPB3	Q12988	150 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	GALNTL6	Q49A17	601 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR2L13	Q8N349	312 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	MEIOB	Q8N635	442 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACBD4	Q8NC06	268 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	ELP4	Q96EB1	424 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	REEP4	Q9H6H4	257 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	GTF3C1	Q12789	2109 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	LINC01387	J3KSC0	135 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	UPK1A	O00322	258 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	SYT5	O00445	386 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	AKAP10	O43572	662 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	IFI6	P09912	130 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	GABRA3	P34903	492 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRKAG1	P54619	331 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	DIO3	P55073	304 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	STX5	Q13190	355 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	GAB1	Q13480	694 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	PCLAF	Q15004	111 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	RAET1L	Q5VY80	246 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	KANK2	Q63ZY3	851 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	DESI1	Q6ICB0	168 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-222	ENST00000614197	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		9.97	□□□□□ -0.81

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