RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 FAM46BQ96A09 425 aa19.1■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 PTERQ96BW5 349 aa19.1■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 FBXL3Q9UKT7 428 aa19.1■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 USP3Q9Y6I4 520 aa19.1■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 BLACEA4D250 179 aa19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 OR6C70A6NIJ9 312 aa19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 AURKAO14965 403 aa19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 AQP9O43315 295 aa19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 UBL4AP11441 157 aa19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 SYCE2Q6PIF2 218 aa19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 DCDC5Q6ZRR9 648 aa19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 SLC6A7Q99884 636 aa19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 DAP3P51398 398 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 OR4K5Q8NGD3 323 aa19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 MYH1P12882 1939 aa19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 SOBPA7XYQ1 873 aa19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 YPEL5P62699 121 aa19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 EDAQ92838 391 aa19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 SLC7A7Q9UM01 511 aa19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 SULT2B1O00204 365 aa19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 ADAP00813 363 aa19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 S100A1P23297 94 aa19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 MAGEA12P43365 314 aa19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 FAM26DQ5JW98 314 aa19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 RFT1Q96AA3 541 aa19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 CA5BQ9Y2D0 317 aa19.09■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 ANTXRLA6NF34 631 aa19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRD28O15084 1053 aa19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 LDB3O75112 727 aa19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 PLBD1Q6P4A8 553 aa19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 A6NIZ1 184 aa19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 RFXAPO00287 272 aa19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 PENKP01210 267 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 EDN1P05305 212 aa19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 MMP2P08253 660 aa19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 SLC26A5P58743 744 aa19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 RAP1BP61224 184 aa19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 RAP1AP62834 184 aa19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM53Q6P2H8 277 aa19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 NELFAQ9H3P2 528 aa19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM9Q9P0T7 183 aa19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF175Q9Y473 711 aa19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 NDUFB2O95178 105 aa19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 IGHEP01854 428 aa19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 PET100P0DJ07 73 aa19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 IFNGR1P15260 489 aa19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 POT1Q9NUX5 634 aa19.08■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 PPP1R3DO95685 299 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 CRABP1P29762 137 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 MAP2K4P45985 399 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 PRLHRP49683 370 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 NKX3-2P78367 333 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 CD83Q01151 205 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 DCAF12Q5T6F0 453 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 NAGSQ8N159 534 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 AGBL5Q8NDL9 886 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 FRS2Q8WU20 508 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 MSANTD3Q96H12 275 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 ULBP3Q9BZM4 244 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 BTNL2Q9UIR0 455 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 H7C417 338 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 PEX14O75381 377 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 FESP07332 822 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 LHCGRP22888 699 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 STK11Q15831 433 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 CDNFQ49AH0 187 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 VTCN1Q7Z7D3 282 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 PIANPQ8IYJ0 282 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 KLHDC9Q8NEP7 349 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 INPP5KQ9BT40 448 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 MYNNQ9NPC7 610 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa19.08■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 CD8B2A6NJW9 211 aa19.07■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 IFNA7P01567 189 aa19.07■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 MAS1P04201 325 aa19.07■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 CD8BP10966 210 aa19.07■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 PVRP15151 417 aa19.07■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 CDKN2CP42773 168 aa19.07■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 MAGEA8P43361 318 aa19.07■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 OR52R1Q8NGF1 315 aa19.07■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 ARL5BQ96KC2 179 aa19.07■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 LCATP04180 440 aa19.07■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 SEC14L1Q92503 715 aa19.07■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 MACROD1Q9BQ69 325 aa19.07■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 MYH13Q9UKX3 1938 aa19.07■□□□□ 0.64
CTDP1-208ENST00000613122 NADSYN1Q6IA69 706 aa19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms