RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-211	ENST00000582232	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	ASRGL1	Q7L266	308 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	PTOV1	Q86YD1	416 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	SLC34A3	Q8N130	599 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	COX18	Q8N8Q8	333 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	GPR151	Q8TDV0	419 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	JADE3	Q92613	823 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	PMM1	Q92871	262 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	CDS1	Q92903	461 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	RAB8B	Q92930	207 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	CDRT15	Q96T59	188 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	ALG2	Q9H553	416 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	POLE3	Q9NRF9	147 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	CBLC	Q9ULV8	474 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	CACNA1G	O43497	2377 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232		A8MUI8	341 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	WWP2	O00308	870 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	GSC2	O15499	205 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	TSPAN2	O60636	221 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	ITGA10	O75578	1167 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	OR2J2	O76002	312 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	KCNK2	O95069	426 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	IL33	O95760	270 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	NUDT7	P0C024	238 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	ARAF	P10398	606 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	ABCD3	P28288	659 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	LIPE	Q05469	1076 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	FUT5	Q11128	374 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	VEZF1	Q14119	521 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	MAPK11	Q15759	364 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	DECR1	Q16698	335 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	CYP51A1	Q16850	503 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	VMAC	Q2NL98	169 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	ACER2	Q5QJU3	275 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	DCST2	Q5T1A1	773 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	LYPD8	Q6UX82	237 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	FBXO30	Q8TB52	745 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	PIK3R3	Q92569	461 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	RASL10B	Q96S79	203 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	SDF2	Q99470	211 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	ADA2	Q9NZK5	511 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	CALML5	Q9NZT1	146 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	MGA	Q8IWI9	3026 aa		10.61	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	TMEM247	A6NEH6	219 aa		10.61	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		10.61	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	MAN1A2	O60476	641 aa		10.61	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	ABCB7	O75027	752 aa		10.61	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	STX11	O75558	287 aa		10.61	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	PPM1B	O75688	479 aa		10.61	□□□□□ -0.71
GGA3-211	ENST00000582232	ITGB2	P05107	769 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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