RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 A8MVJ9 347 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 TP53I11O14683 189 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 HS6ST1O60243 411 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 CLPSP04118 112 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 CT45A8P0DMV1 189 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 CT45A9P0DMV2 189 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 OR12D1P0DN82 309 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ETFAP13804 333 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SOX18P35713 384 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 PIGAP37287 484 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 CLK3P49761 638 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 GZMMP51124 257 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 PNLIPRP2P54317 469 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 PSG6Q00889 435 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ATP1A4Q13733 1029 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SCARB2Q14108 478 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 EFR3AQ14156 821 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 TGIF1Q15583 401 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 MEP1AQ16819 746 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 CT45A2Q5DJT8 189 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 CRB2Q5IJ48 1285 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 H3F3CQ6NXT2 135 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 CCDC80Q76M96 950 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 IFNEQ86WN2 208 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 DHFR2Q86XF0 187 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SHISA5Q8N114 240 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SLC34A3Q8N130 599 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 HORMAD2Q8N7B1 307 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ZNF441Q8N8Z8 693 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ZNF527Q8NB42 609 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SLC16A11Q8NCK7 471 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SLC38A5Q8WUX1 472 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 LZICQ8WZA0 190 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 GATA6Q92908 595 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ADIPOR1Q96A54 375 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 RNF31Q96EP0 1072 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SLC35A4Q96G79 324 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 C16orf58Q96GQ5 468 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 LRGUKQ96M69 825 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 GAL3ST4Q96RP7 486 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 LHPPQ9H008 270 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 IKZF5Q9H5V7 419 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 WDR70Q9NW82 654 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ACTR3BQ9P1U1 418 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 RPS6KA6Q9UK32 745 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 IFT52Q9Y366 437 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SNX13Q9Y5W8 968 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ACACAQ13085 2346 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 OR6C70A6NIJ9 312 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 AQP12BA6NM10 295 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 HRKO00198 91 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 CXCR6O00574 342 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 EFSO43281 561 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SLC28A2O43868 658 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 IL33O95760 270 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ALPPP05187 535 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 NGFRP08138 427 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ACP2P11117 423 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 UMPSP11172 480 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 NQO1P15559 274 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 GGT1P19440 569 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SPINK2P20155 84 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 IL12BP29460 328 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 FOXK2Q01167 660 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 CDC20Q12834 499 aa8.62□□□□□ -1.03
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CS-220ENST00000550700 CEACAM7Q14002 265 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SELPLGQ14242 412 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ADRM1Q16186 407 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 DUSP5Q16690 384 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 GPAT3Q53EU6 434 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 COX20Q5RI15 118 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 DCST2Q5T1A1 773 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 NUP54Q7Z3B4 507 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 VASH2Q86V25 355 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 AQP12AQ8IXF9 295 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 C9orf40Q8IXQ3 194 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 PEX5LQ8IYB4 626 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ZZZ3Q8IYH5 903 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 CLEC4FQ8N1N0 589 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 FAM110BQ8TC76 370 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SPPL2AQ8TCT8 520 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SLC26A7Q8TE54 656 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 TTC9Q92623 222 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 CDS1Q92903 461 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 TMCO6Q96DC7 493 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 DTNBP1Q96EV8 351 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SGCZQ96LD1 299 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 LMF1Q96S06 567 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
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