RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 NADKO95544 446 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 ALOX5P09917 674 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 NPIPA8P0DM63 369 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 GGT1P19440 569 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 CLCN2P51788 898 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 CDK6Q00534 326 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 CHAF1BQ13112 559 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 SCARB2Q14108 478 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 EXT1Q16394 746 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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CS-216ENST00000549221 LYPD8Q6UX82 237 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 HSDL2Q6YN16 418 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 FRRS1Q6ZNA5 592 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 SLC29A4Q7RTT9 530 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
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CS-216ENST00000549221 ARHGAP24Q8N264 748 aa7.53□□□□□ -1.2
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CS-216ENST00000549221 C11orf65Q8NCR3 313 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 ZNF248Q8NDW4 579 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 C7orf57Q8NEG2 295 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 M1APQ8TC57 530 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 FAM110BQ8TC76 370 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 GPR151Q8TDV0 419 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 ADAMTS15Q8TE58 950 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 PSMF1Q92530 271 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 NACC2Q96BF6 587 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 ZG16BQ96DA0 208 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 STACQ99469 402 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 SLC38A1Q9H2H9 487 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 FLRT3Q9NZU0 649 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 DKK4Q9UBT3 224 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 PRODH2Q9UF12 536 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 SNX13Q9Y5W8 968 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-216ENST00000549221 MED13Q9UHV7 2174 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 TCRBV5S2A0A599 114 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 CFAP73A6NFT4 308 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 ARGFXA6NJG6 315 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 CXCR6O00574 342 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 PGM3O95394 542 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 H6PDO95479 791 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 OPN1SWP03999 348 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 C1QTNF9P0C862 333 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 NR2F1P10589 423 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 DRD5P21918 477 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 PIGAP37287 484 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 MAGEA8P43361 318 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 PPICP45877 212 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 RFX3P48380 749 aa7.52□□□□□ -1.21
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CS-216ENST00000549221 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 CHRNEQ04844 493 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 CDC20Q12834 499 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 CCNIQ14094 377 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 DCAF10Q5QP82 559 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 DCST2Q5T1A1 773 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 TCTN3Q6NUS6 607 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 CYP2R1Q6VVX0 501 aa7.52□□□□□ -1.21
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CS-216ENST00000549221 COMTD1Q86VU5 262 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 SIRT6Q8N6T7 355 aa7.52□□□□□ -1.21
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CS-216ENST00000549221 HIPK4Q8NE63 616 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 OR8K3Q8NH51 312 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 NUBPLQ8TB37 319 aa7.52□□□□□ -1.21
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CS-216ENST00000549221 FIG4Q92562 907 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 TMBIM1Q969X1 311 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 TAMM41Q96BW9 452 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 ASB9Q96DX5 294 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 SDF2Q99470 211 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 SPATA9Q9BWV2 254 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 BTBD2Q9BX70 525 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 ZNF350Q9GZX5 532 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-216ENST00000549221 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
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