RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 OR10H1Q9Y4A9 318 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 KCNE3Q9Y6H6 103 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 CACNA1GO43497 2377 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 PRORSD1PA6NEY8 169 aa20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 GSC2O15499 205 aa20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 NUDT7P0C024 238 aa20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 ARAFP10398 606 aa20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 NAGAP17050 411 aa20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 ITGA3P26006 1051 aa20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 NRG3P56975 720 aa20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 ERICH5Q6P6B1 374 aa20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 C11orf65Q8NCR3 313 aa20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC38A5Q8WUX1 472 aa20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 PIK3R3Q92569 461 aa20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 MGAQ8IWI9 3026 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 A8MUI8 341 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM220BPB1ANY3 271 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 DNAJB5O75953 348 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 KCNK2O95069 426 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 NADKO95544 446 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 ABCD3P28288 659 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 SOX11P35716 441 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 GSK3BP49841 420 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 GNA13Q14344 377 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 FXNQ16595 210 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 OR2T12Q8NG77 320 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC22A8Q8TCC7 542 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF354BQ96LW1 612 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 CPNE5Q9HCH3 593 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 POLE3Q9NRF9 147 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 GXYLT2A0PJZ3 443 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM247A6NEH6 219 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 WWP2O00308 870 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 ITGA10O75578 1167 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 CEACAM4O75871 244 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 OR2J2O76002 312 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 FUT5Q11128 374 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 CEACAM7Q14002 265 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 VEZF1Q14119 521 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 MAPK11Q15759 364 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 NNATQ16517 81 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 DECR1Q16698 335 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 MEP1AQ16819 746 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 VMACQ2NL98 169 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 CRB2Q5IJ48 1285 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 ACER2Q5QJU3 275 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 DCST2Q5T1A1 773 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 C16orf62Q7Z3J2 963 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC30A8Q8IWU4 369 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 ZZZ3Q8IYH5 903 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC34A3Q8N130 599 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 OR4N2Q8NGD1 307 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 MAL2Q969L2 176 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 RASL10BQ96S79 203 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 SDF2Q99470 211 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 THTPAQ9BU02 230 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 G6PC3Q9BUM1 346 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 CDCP1Q9H5V8 836 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 ZZEF1O43149 2961 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 HTR1EP28566 365 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 LCN1P31025 176 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 CDK6Q00534 326 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 PGM2L1Q6PCE3 622 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 SIRT6Q8N6T7 355 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 BCORP1Q8N888 145 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 TNIP2Q8NFZ5 429 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 PMM1Q92871 262 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF350Q9GZX5 532 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 CALML5Q9NZT1 146 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 ELOVL7A1L3X0 281 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 ABCB7O75027 752 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 IL33O95760 270 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-205ENST00000528462 NR2F1P10589 423 aa20.29■□□□□ 0.84
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