RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 CLPTM1O96005 669 aa21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 H1F0P07305 194 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 FBLP22087 321 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 GABRA3P34903 492 aa21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 EMDP50402 254 aa21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 RPS6KA3P51812 740 aa21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 KEAP1Q14145 624 aa21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 ZNF691Q5VV52 312 aa21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 TSPAN14Q8NG11 270 aa21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 FOLH1BQ9HBA9 442 aa21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 RLIMQ9NVW2 624 aa21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 CHST2Q9Y4C5 530 aa21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 VPS13AQ96RL7 3174 aa21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 HRKO00198 91 aa21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 SSTR4P31391 388 aa21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 SMIM11AP58511 58 aa21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 DAB2P98082 770 aa21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 ZNF619Q8N2I2 560 aa21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 OR9Q2Q8NGE9 314 aa21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 PTCHD1Q96NR3 888 aa21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 GABARAPL3Q9BY60 117 aa21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 SRPK3Q9UPE1 567 aa21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 TRIM64A6NGJ6 449 aa21.61■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 PRAMEF2O60811 474 aa21.61■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 IFNA16P05015 189 aa21.61■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 ATXN8OSP0DMR3 200 aa21.61■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 CYP4B1P13584 511 aa21.61■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 PSG6Q00889 435 aa21.61■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 FUT7Q11130 342 aa21.61■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 NPRL3Q12980 569 aa21.61■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 FGD3Q5JSP0 725 aa21.61■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 QSOX2Q6ZRP7 698 aa21.61■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 RCBTB1Q8NDN9 531 aa21.61■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 VSTM2LQ96N03 204 aa21.61■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 CNPPD1Q9BV87 410 aa21.61■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 KLHL28Q9NXS3 571 aa21.61■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 TMCC3Q9ULS5 477 aa21.61■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 ZNF232Q9UNY5 417 aa21.61■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 POFUT2Q9Y2G5 429 aa21.61■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 AGAP5A6NIR3 686 aa21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 KIAA0513O60268 411 aa21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 UGT2B17O75795 530 aa21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 THBS1P07996 1170 aa21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 ATP6V1B1P15313 513 aa21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 AVPR2P30518 371 aa21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 CLK3P49761 638 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 GPR68Q15743 365 aa21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 NPTX1Q15818 432 aa21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 PMM1Q92871 262 aa21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 PRRC1Q96M27 445 aa21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 POLE3Q9NRF9 147 aa21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 ERVK-19Q9WJR5 959 aa21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 GXYLT2A0PJZ3 443 aa21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 RYKP34925 604 aa21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 ISL1P61371 349 aa21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 RAPSNQ13702 412 aa21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 DCST1Q5T197 706 aa21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 ARHGAP40Q5TG30 622 aa21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 SETD9Q8NE22 299 aa21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 CCDC74BQ96LY2 380 aa21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 FER1L5A0AVI2 2057 aa21.59■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa21.59■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 A0A1W2PRQ8 180 aa21.59■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 E9PQ18 207 aa21.59■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 TFAP2AP05549 437 aa21.59■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 IL7RP16871 459 aa21.59■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 CBLP22681 906 aa21.59■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 EPHA2P29317 976 aa21.59■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 MPLP40238 635 aa21.59■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 PGDP52209 483 aa21.59■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 DGCR6Q14129 220 aa21.59■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 C1orf189Q5VU69 101 aa21.59■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 AP1ARQ63HQ0 302 aa21.59■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 RHBDD2Q6NTF9 364 aa21.59■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa21.59■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 CLIP4Q8N3C7 705 aa21.59■■□□□ 1.05
ACER3-204ENST00000525861 FKBP10Q96AY3 582 aa21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms