RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 NEDD8Q15843 81 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 FXNQ16595 210 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 POM121L1PQ3SYA9 428 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 MINDY4Q4G0A6 757 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 LIN54Q6MZP7 749 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 KCTD8Q6ZWB6 473 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 TMEM150AQ86TG1 271 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 PAQR7Q86WK9 346 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 CALHM3Q86XJ0 350 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 SLC44A3Q8N4M1 653 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ESX1Q8N693 406 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 KAT2AQ92830 837 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 PYCR2Q96C36 320 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 COG8Q96MW5 612 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 VN1R3Q9BXE9 311 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 DNPH1O43598 174 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 PPP1R3BQ86XI6 285 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 TMEM151BQ8IW70 566 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ACBD7Q8N6N7 88 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ZNF321PQ8N8H1 164 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 OR5AR1Q8NGP9 310 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 LRRN4Q8WUT4 740 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 AMDHD1Q96NU7 426 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 CDADC1Q9BWV3 514 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 TOR3AQ9H497 397 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 CUTCQ9NTM9 273 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 MAT2BQ9NZL9 334 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 POLHQ9Y253 713 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 NOX1Q9Y5S8 564 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 PRSS21Q9Y6M0 314 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 SESN1Q9Y6P5 492 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 GABRR3A8MPY1 467 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 IQCF5A8MTL0 148 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 TMEM233B4DJY2 109 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 PLD2O14939 933 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ITGB2P05107 769 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 JMJD7P0C870 316 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 LAMP1P11279 417 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 FMO3P31513 532 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 MAP4K2Q12851 820 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 PTGR1Q14914 329 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 MAPK14Q16539 360 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 GLT8D1Q68CQ7 371 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ATCAYQ86WG3 371 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 TP53INP2Q8IXH6 220 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 SMRP1Q8NCR6 262 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ANKK1Q8NFD2 765 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 OR52N1Q8NH53 320 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 STK35Q8TDR2 534 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 TM4SF18Q96CE8 201 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 HRASLS5Q96KN8 279 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 PTCHD1Q96NR3 888 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 CDK15Q96Q40 435 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 F2RL3Q96RI0 385 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 PITX2Q99697 317 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 GRHPRQ9UBQ7 328 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ERVK-11Q9UQG0 969 aa5.5□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ANKRD61A6NGH8 418 aa5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 GPR171O14626 319 aa5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 NGFRP08138 427 aa5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 GDF5P43026 501 aa5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 NR4A2P43354 598 aa5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 MAGEA2P43356 314 aa5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 PPICP45877 212 aa5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 MTNR1AP48039 350 aa5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 SLC6A11P48066 632 aa5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 PNLIPRP2P54317 469 aa5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 RAB14P61106 215 aa5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 C17orf67Q0P5P2 114 aa5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 CDKN3Q16667 212 aa5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ZNF691Q5VV52 312 aa5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 SLC30A6Q6NXT4 461 aa5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 FAM129CQ86XR2 697 aa5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 DTWD1Q8N5C7 304 aa5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 NETO2Q8NC67 525 aa5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 SLC41A3Q96GZ6 507 aa5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 SLC22A12Q96S37 553 aa5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 TSSK6Q9BXA6 273 aa5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 SLC6A16Q9GZN6 736 aa5.49□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 OPA3Q9H6K4 179 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms