RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM81Q6P7N7 255 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP17.08■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 NUP54Q7Z3B4 507 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 SZRD1Q7Z422 152 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 NEIL3Q8TAT5 605 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF138Q8WVD3 245 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 GIMAP5Q96F15 307 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 PNPOQ9NVS9 261 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC6A5Q9Y345 797 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 RAP2CQ9Y3L5 183 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 OR10H1Q9Y4A9 318 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 FBN2P35556 2912 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 GXYLT2A0PJZ3 443 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 OR14I1A6ND48 311 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 SUSD5O60279 629 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 HCN1O60741 890 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 SNX4O95219 450 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 G6PDP11413 515 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 MAPK1P28482 360 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 NUP107P57740 925 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 RPP38P78345 283 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 CASP8Q14790 479 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 TIGD3Q6B0B8 471 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 GALNT10Q86SR1 603 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 CROCCP2Q86T23 111 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 PACS2Q86VP3 889 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 WDSUB1Q8N9V3 476 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 PIK3R3Q92569 461 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 RTN4RQ9BZR6 473 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 SERHLQ9NQF3 203 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 QPCTLQ9NXS2 382 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP6V1HQ9UI12 483 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 HAO1Q9UJM8 370 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 WIF1Q9Y5W5 379 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 DCHS2Q6V1P9 2916 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 PKDREJQ9NTG1 2253 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 BCKDKO14874 412 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAPPC6AO75865 159 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV1D-16P01601 117 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 HPNP05981 417 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 ACP2P11117 423 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 RFX3P48380 749 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 GAS1P54826 345 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 GAB1Q13480 694 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 HHATQ5VTY9 493 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC30A6Q6NXT4 461 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 OR1J4Q8NGS1 313 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFP28Q8NHY6 868 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 SDCCAG3Q96C92 435 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 MTERF3Q96E29 417 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 NUF2Q9BZD4 464 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 AKTIPQ9H8T0 292 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 ACKR4Q9NPB9 350 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXL2Q9UKC9 423 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 CBLCQ9ULV8 474 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 MED12LQ86YW9 2145 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 SCO2O43819 266 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 IFI6P09912 130 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 GRK2P25098 689 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 ACVR2AP27037 513 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 HTR1EP28566 365 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 EVI2BP34910 448 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT20P35900 424 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 RPL14P50914 215 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 SMSP52788 366 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 PRKAG1P54619 331 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 DIO3P55073 304 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 MANFP55145 182 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 WNT3P56703 355 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 STX3Q13277 289 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 ART3Q13508 389 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 TOMM20Q15388 145 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 OR5M10Q6IEU7 315 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 RIMKLAQ8IXN7 391 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 ARL8AQ96BM9 186 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 SARAFQ96BY9 339 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 MS4A4EQ96PG1 132 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 ACAD8Q9UKU7 415 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 FIGNL2A6NMB9 653 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCB7O75027 752 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 CLDN14O95500 239 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 PRPS2P11908 318 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.9 ms