RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508124.5

SLC38A9-215, Transcript of solute carrier family 38 member 9, human

TSL 2

Gene SLC38A9, Length 2,370 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A9-215	ENST00000508124	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	CXADR	P78310	365 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	ZNF33B	Q06732	778 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	PCDH1	Q08174	1060 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	POU4F2	Q12837	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	ART3	Q13508	389 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	RGN	Q15493	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	CYP51A1	Q16850	503 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	ARSK	Q6UWY0	536 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	DTX1	Q86Y01	620 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	BEST3	Q8N1M1	668 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	RPRML	Q8N4K4	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	GPR119	Q8TDV5	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	GRHL3	Q8TE85	626 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	NRG4	Q8WWG1	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	GNRHR2	Q96P88	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	DGAT2	Q96PD7	388 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	CDC6	Q99741	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	RAB33B	Q9H082	229 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	AURKC	Q9UQB9	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	POMP	Q9Y244	141 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	FAM166B	A8MTA8	275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	SERPINA1	P01009	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	PEPD	P12955	493 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	PRPS1L1	P21108	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	MATN1	P21941	496 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	PRPH2	P23942	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	CXCR2	P25025	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	HPCAL1	P37235	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	CCR4	P51679	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	VLDLR	P98155	873 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	ACY1	Q03154	408 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	OCA2	Q04671	838 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	NPTX1	Q15818	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	GPAT3	Q53EU6	434 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	C4orf17	Q53FE4	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	PIGG	Q5H8A4	983 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	MED25	Q71SY5	747 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	GLRX5	Q86SX6	157 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	SERPINA11	Q86U17	422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	KDM8	Q8N371	416 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	ESX1	Q8N693	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	REPS1	Q96D71	796 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	VDAC3	Q9Y277	283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124	STMND1	H3BQB6	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A9-215	ENST00000508124		M0QX08	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms