RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000500401.2

SPCS2P3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 2 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene SPCS2P3, Length 656 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS2P3-201ENST00000500401 CPTPQ5TA50 214 aa22.1■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 NUP43Q8NFH3 380 aa22.1■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 RNF138Q8WVD3 245 aa22.1■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 TMEM41AQ96HV5 264 aa22.1■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 PCNX1Q96RV3 2341 aa22.1■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 UBQLN3Q9H347 655 aa22.1■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 OR10H1Q9Y4A9 318 aa22.1■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 A0A1W2PRB8 838 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 PRRG2O14669 202 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 ANKRD28O15084 1053 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 SNX4O95219 450 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 C6orf47O95873 294 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 IGKV1D-16P01601 117 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 PRPS1L1P21108 318 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 GDF1P27539 372 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 PTPN6P29350 595 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 MASP1P48740 699 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 CASP6P55212 293 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 C21orf58P58505 322 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 RPP38P78345 283 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 MLC1Q15049 377 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 CDSNQ15517 529 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 HDXQ7Z353 690 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 SZRD1Q7Z422 152 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 MAVSQ7Z434 540 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 OR5M9Q8NGP3 310 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 PIK3R3Q92569 461 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 C16orf58Q96GQ5 468 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 DMRTA2Q96SC8 542 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 CXorf36Q9H7Y0 433 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 PNPLA3Q9NST1 481 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 KLRF1Q9NZS2 232 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 CBLCQ9ULV8 474 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 C15orf41Q9Y2V0 281 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 GOLGA8OA6NCC3 632 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 GOLGA8NF8WBI6 632 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 SNPHO15079 494 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 LBPP18428 481 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 IL12BP29460 328 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 GABRA3P34903 492 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 RPL3P39023 403 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 PNLIPRP2P54317 469 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 WNT3P56703 355 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 ATG16L1Q676U5 607 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 TIGD3Q6B0B8 471 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 SLC30A6Q6NXT4 461 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 PAOXQ6QHF9 649 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 PACS2Q86VP3 889 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 MARVELD2Q8N4S9 558 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 WDSUB1Q8N9V3 476 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 YIPF4Q9BSR8 244 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 RTN4RQ9BZR6 473 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 LDAHQ9H6V9 325 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 MAPRE3Q9UPY8 281 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS2P3-201ENST00000500401 NOTCH2Q04721 2471 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 AQP7O14520 342 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 HDAC3O15379 428 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 EMC8O43402 210 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 EPHA3P29320 983 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 MAN2A2P49641 1150 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 GAS1P54826 345 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 PHC1P78364 1004 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 CYP27C1Q4G0S4 372 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 GXYLT1Q4G148 440 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 OR4F3Q6IEY1 312 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 CAMKMTQ7Z624 323 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 GALNT10Q86SR1 603 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 CLECL1Q8IZS7 167 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 SLC16A11Q8NCK7 471 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 OR5P2Q8WZ92 322 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 TMCO6Q96DC7 493 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 DUSP26Q9BV47 211 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 ACKR4Q9NPB9 350 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 QPCTLQ9NXS2 382 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 MED12Q93074 2177 aa22.06■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 UNC79Q9P2D8 2635 aa22.06■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 ZNF195O14628 629 aa22.06■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 SUSD5O60279 629 aa22.06■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 ABCB7O75027 752 aa22.06■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 NKX2-2O95096 273 aa22.06■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 KRT20P35900 424 aa22.06■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 RFX3P48380 749 aa22.06■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 EFR3AQ14156 821 aa22.06■■□□□ 1.12
SPCS2P3-201ENST00000500401 DUSP5Q16690 384 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms