RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 GGT5P36269 586 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 PIK3CBP42338 1070 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 MAGEA3P43357 314 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 XKP51811 444 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 ARFIP1P53367 373 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 BSPH1Q075Z2 132 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 GGTLC2Q14390 218 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 ACAP2Q15057 778 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 GUSBP1Q15486 140 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 CDKL4Q5MAI5 379 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 FIGNL1Q6PIW4 674 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 ZNF662Q6ZS27 426 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 NUDT13Q86X67 352 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 LAS2Q8IYD9 372 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 FBXL14Q8N1E6 418 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 BANPQ8N9N5 519 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 OR7G3Q8NG95 312 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 OR52R1Q8NGF1 315 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 HUS1BQ8NHY5 278 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 EXT2Q93063 718 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 TMBIM1Q969X1 311 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 CFAP36Q96G28 342 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 ADOQ96SZ5 270 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 POTEKPQ9BYX7 375 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 TRIM2Q9C040 744 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 DERL2Q9GZP9 239 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 FOLH1BQ9HBA9 442 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 SMYD2Q9NRG4 433 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 SDHAF3Q9NRP4 125 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 WHRNQ9P202 907 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 PLLPQ9Y342 182 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 ZNF337Q9Y3M9 751 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 ASB4Q9Y574 426 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 DYSFO75923 2080 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 A0A1W2PS29 197 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 ESYT3A0FGR9 886 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 OR2M5A3KFT3 312 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 SLC35F4A4IF30 521 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 ABCD4O14678 606 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 PGRMC2O15173 223 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 TAPBPO15533 448 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 ZSCAN12O43309 604 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 NDUFB5O43674 189 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 GUCY1B2O75343 617 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 CD8AP01732 235 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 EGR1P18146 543 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 IL11P20809 199 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 PTNP21246 168 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 DRD5P21918 477 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 ADH6P28332 368 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 PPICP45877 212 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 CLK3P49761 638 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 CLDN20P56880 219 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 C21orf58P58505 322 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 B3GALT5-AS1P59052 145 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 PSPHP78330 225 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 IRF9Q00978 393 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 STX5Q13190 355 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 TAB1Q15750 504 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 STK11Q15831 433 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 CR1LQ2VPA4 569 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 TMEM201Q5SNT2 666 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 PDSS1Q5T2R2 415 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 GRHL2Q6ISB3 625 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 EXOC3L1Q86VI1 746 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 PPIL6Q8IXY8 311 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 CEP112Q8N8E3 955 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 PDPRQ8NCN5 879 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 TRIM58Q8NG06 486 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 OR52B6Q8NGF0 335 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 OR5M1Q8NGP8 315 aa5.49□□□□□ -1.53
CBX1-205ENST00000495350 C10orf105Q8TEF2 133 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms