RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 SLC9A6Q92581 669 aa8.07□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 HSPBAP1Q96EW2 488 aa8.07□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 COL21A1Q96P44 957 aa8.07□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 BTBD9Q96Q07 612 aa8.07□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 YIPF4Q9BSR8 244 aa8.07□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 MECRQ9BV79 373 aa8.07□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 OR2B2Q9GZK3 357 aa8.07□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 TUBB1Q9H4B7 451 aa8.07□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 EQTNQ9NQ60 294 aa8.07□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 GALNT8Q9NY28 637 aa8.07□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 TAS2R10Q9NYW0 307 aa8.07□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.07□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 MPDZO75970 2070 aa8.07□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 FAM221AA4D161 298 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 A6NNC1 897 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 CAPN14A8MX76 684 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 AHRRA9YTQ3 701 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 MYO1GB0I1T2 1018 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 UPK1AO00322 258 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 PLOD2O00469 737 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 DVL2O14641 736 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 TO15178 435 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 SEC14L5O43304 696 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 PLIN3O60664 434 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 IL2RAP01589 272 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 MYL2P10916 166 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 CAPN3P20807 821 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 TIMP3P35625 211 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 CPOXP36551 454 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 TMED10P49755 219 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 CLDN20P56880 219 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 SIRPAP78324 504 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 FAM27E3Q08E93 113 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 HSPB3Q12988 150 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 PCLAFQ15004 111 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 FLYWCH1Q4VC44 716 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 NHSL2Q5HYW2 709 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 SLC30A6Q6NXT4 461 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 OLIG3Q7RTU3 272 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 IFNEQ86WN2 208 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 PLCZ1Q86YW0 608 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 C10orf107Q8IVU9 208 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 IFT20Q8IY31 132 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 FAM9CQ8IZT9 166 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 MNS1Q8NEH6 495 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 C17orf47Q8NEP4 570 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 OR2M3Q8NG83 312 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF675Q8TD23 568 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 SMPDL3BQ92485 455 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 SLC35A4Q96G79 324 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 BBS4Q96RK4 519 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 FAIM2Q9BWQ8 316 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 CLCF1Q9UBD9 225 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF337Q9Y3M9 751 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 VPS13CQ709C8 3753 aa8.06□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 HEATR5AQ86XA9 2040 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 OR6C70A6NIJ9 312 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 CD8B2A6NJW9 211 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 NPIPA7E9PJI5 369 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 H3BML4 177 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 FADS1O60427 444 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 GUCY1B2O75343 617 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 SPAG7O75391 227 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 TNFSF13O75888 250 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 NTN1O95631 604 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 LINC00032P0C843 101 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 NPIPA8P0DM63 369 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 DRD2P14416 443 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 DDCP20711 480 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 IL11P20809 199 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 CTSSP25774 331 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 DPP4P27487 766 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 IL12BP29460 328 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 EVI2BP34910 448 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF763Q0D2J5 394 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 KIAA0040Q15053 153 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 IMPG1Q17R60 797 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 CCNJQ5T5M9 372 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 ANKRD34AQ69YU3 496 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 NOXRED1Q6NXP6 359 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 FIGNL1Q6PIW4 674 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 Q6ZSR9 355 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 FRMD7Q6ZUT3 714 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF550Q7Z398 422 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa8.05□□□□□ -1.12
HDAC3-211ENST00000491581 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.05□□□□□ -1.12
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