RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486042.1

PHC3-211, Transcript of polyhomeotic homolog 3, humanhuman

TSL 3

Gene PHC3, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC3-211ENST00000486042 GJB2P29033 226 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 PRKAR2BP31323 418 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 FEN1P39748 380 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 OPRL1P41146 370 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 TSFMP43897 325 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 PSMD7P51665 324 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 TPM4P67936 248 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 CNTN1Q12860 1018 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 SPP2Q13103 211 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 GPR50Q13585 617 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 MTF1Q14872 753 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 PDK3Q15120 406 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 STK38Q15208 465 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 MAPK6Q16659 721 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 HLA-BQ31612 363 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 SLC36A3Q495N2 470 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 GPAT3Q53EU6 434 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 TMEM41BQ5BJD5 291 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 SPANXN4Q5MJ08 99 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 PLPP4Q5VZY2 271 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 FAM173BQ6P4H8 233 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 CD164L2Q6UWJ8 174 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 Q6ZRP5 223 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 CHMP1BQ7LBR1 199 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 VPS36Q86VN1 386 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 LRRC6Q86X45 466 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 SYCE1Q8N0S2 351 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 TCAIMQ8N3R3 496 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 LEMD2Q8NC56 503 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 FAM71CQ8NEG0 241 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 OR13C5Q8NGS8 318 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 HAS2Q92819 552 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 FOXN4Q96NZ1 517 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 C19orf43Q9BQ61 176 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 ZNF577Q9BSK1 485 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 CCM2Q9BSQ5 444 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 WWTR1Q9GZV5 400 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 HOXD1Q9GZZ0 328 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 HDHD2Q9H0R4 259 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 ADNPQ9H2P0 1102 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 VCX2Q9H322 139 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 FN3KRPQ9HA64 309 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 PILRAQ9UKJ1 303 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 KIAA1257Q9ULG3 409 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 DDX19BQ9UMR2 479 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 KCNK6Q9Y257 313 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 ETV7Q9Y603 341 aa3.04□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 ERICH2A1L162 156 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 ARHGAP42A6NI28 874 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 TMEM210A6NLX4 147 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 LMO7DNF2Z398 122 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 H3BQV1 296 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 PDLIM1O00151 329 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 PSMD11O00231 422 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 CHUKO15111 745 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 RRP8O43159 456 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 PSMD3O43242 534 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 ARHGEF9O43307 516 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 LRCH4O75427 683 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 CEACAM4O75871 244 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 CABYRO75952 493 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 NXPH2O95156 264 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 CXCL14O95715 111 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 NDUFB10O96000 172 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 GLAP06280 429 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 PGK2P07205 417 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 CHRNGP07510 517 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 GSTA2P09210 222 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 MYOGP15173 224 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 EZRP15311 586 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 DRD5P21918 477 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 HTR2AP28223 471 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 MMP12P39900 470 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 CBX5P45973 191 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 SLC6A12P48065 614 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 HSPA13P48723 471 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 TNFSF10P50591 281 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 KRTAP12-2P59991 146 aa3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP3.03□□□□□ -1.92
PHC3-211ENST00000486042 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms