RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483164.5

GIGYF2-238, Transcript of GRB10 interacting GYF protein 2, human

TSL 5

Gene GIGYF2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIGYF2-238	ENST00000483164	SCRN2	Q96FV2	425 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIGYF2-238	ENST00000483164	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIGYF2-238	ENST00000483164	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIGYF2-238	ENST00000483164	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIGYF2-238	ENST00000483164	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GIGYF2-238	ENST00000483164	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GIGYF2-238	ENST00000483164	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIGYF2-238	ENST00000483164	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIGYF2-238	ENST00000483164	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIGYF2-238	ENST00000483164	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIGYF2-238	ENST00000483164	S100A14	Q9HCY8	104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIGYF2-238	ENST00000483164	GDF3	Q9NR23	364 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIGYF2-238	ENST00000483164	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIGYF2-238	ENST00000483164	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIGYF2-238	ENST00000483164	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIGYF2-238	ENST00000483164	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIGYF2-238	ENST00000483164	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIGYF2-238	ENST00000483164	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164		A0A1B0GUH1	482 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164		A0A1W2PPE3	182 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	HHLA1	C9JL84	531 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164		H0YL77	283 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	HAS3	O00219	553 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	SH2D1B	O14796	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	CFLAR	O15519	480 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	P2RX6	O15547	441 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	WDR1	O75083	606 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	CLPX	O76031	633 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	PRPS2	P11908	318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	HOXB2	P14652	356 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	UGT1A5	P35504	534 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	AHR	P35869	848 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	SLC1A4	P43007	532 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	BCAP31	P51572	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	TPM4	P67936	248 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	CNTN1	Q12860	1018 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	TGFBI	Q15582	683 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	NAGS	Q8N159	534 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	ALLC	Q8N6M5	410 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	CCDC185	Q8N715	623 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	PQLC3	Q8N755	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	C17orf50	Q8WW18	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	LHX4	Q969G2	390 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	TOP1MT	Q969P6	601 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	PELI1	Q96FA3	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	FZD3	Q9NPG1	666 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	ATP10A	O60312	1499 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	SHISA7	A6NL88	538 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	IQCF5	A8MTL0	148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164		A8MVM7	634 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	OR7A17	O14581	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	MLNR	O43193	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	CLDN9	O95484	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	MB	P02144	154 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	FCER2	P06734	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	TUBG1	P23258	451 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	GYG1	P46976	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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