RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469307.4

PGAP2-215, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 3

Gene PGAP2, Length 798 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-215	ENST00000469307	ARSK	Q6UWY0	536 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307		Q6ZSR9	355 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	CDH24	Q86UP0	819 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	FADS6	Q8N9I5	356 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	KAT2A	Q92830	837 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	CCT7	Q99832	543 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	UPK1A	O00322	258 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC28A1	O00337	649 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	GNB5	O14775	395 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	HCRTR2	O43614	444 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	ZIC3	O60481	467 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	TRAPPC6A	O75865	159 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	LHX2	P50458	406 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	C2orf80	Q0P641	193 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	TRABD2A	Q86V40	505 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	BANP	Q8N9N5	519 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	ELP4	Q96EB1	424 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	BBS4	Q96RK4	519 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	ADO	Q96SZ5	270 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	EBPL	Q9BY08	206 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	SERHL	Q9NQF3	203 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	C1orf109	Q9NX04	203 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	LINC01387	J3KSC0	135 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	AZIN1	O14977	448 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	NPHS1	O60500	1241 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	TRIM13	O60858	407 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	REM1	O75628	298 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	CTAG2	O75638	210 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	RCBTB2	O95199	551 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	IL33	O95760	270 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	IL2RA	P01589	272 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	NGFR	P08138	427 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF708	P17019	499 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	GRK2	P25098	689 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	TACR1	P25103	407 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	CTSS	P25774	331 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	NTS	P30990	170 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	OPRM1	P35372	400 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	GCK	P35557	465 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	SERPINB5	P36952	375 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	MC3R	P41968	323 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	SLCO1A2	P46721	670 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	IMPG1	Q17R60	797 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	CFAP157	Q5JU67	520 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	KANK2	Q63ZY3	851 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM222B	Q8WU58	562 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	NINJ1	Q92982	152 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	WNT2B	Q93097	391 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	MTERF3	Q96E29	417 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	LRRC46	Q96FV0	321 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	APOPT1	Q96IL0	206 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF559	Q9BR84	538 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	HHATL	Q9HCP6	504 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PGAP2-215	ENST00000469307	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		11.21	□□□□□ -0.61

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