RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 TM4SF18Q96CE8 201 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 FBXL20Q96IG2 436 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 PPP1R36Q96LQ0 422 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 CCT8L2Q96SF2 557 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 GIMAP4Q9NUV9 329 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 DCTN4Q9UJW0 460 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 UTS2RQ9UKP6 389 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 PSME2Q9UL46 239 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 CBLCQ9ULV8 474 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 TRAF6Q9Y4K3 522 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 USH1CQ9Y6N9 552 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 CAPN14A8MX76 684 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 SLCO1B7G3V0H7 640 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 SLC28A1O00337 649 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 NDUFAB1O14561 156 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 RGS14O43566 566 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 SEC22BO75396 215 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 TGDSO95455 350 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 FAM107AO95990 144 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 INHBBP09529 407 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 CT62P0C5K7 136 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 LINC00032P0C843 101 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 CCL3P10147 92 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 PORP16435 677 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 TACR1P25103 407 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 OPRM1P35372 400 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 GCKP35557 465 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 ZNF763Q0D2J5 394 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 HEPACAMQ14CZ8 416 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 SPRED3Q2MJR0 410 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 GALNTL6Q49A17 601 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 KANK2Q63ZY3 851 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 CLEC9AQ6UXN8 241 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 MAVSQ7Z434 540 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 ADCY4Q8NFM4 1077 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 NEIL3Q8TAT5 605 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 TWIST2Q8WVJ9 160 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 YIPF4Q9BSR8 244 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 NUF2Q9BZD4 464 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 MIEF1Q9NQG6 463 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 KLHL14Q9P2G3 628 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 HEY2Q9UBP5 337 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 BCAP29Q9UHQ4 241 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 JMJD1CQ15652 2540 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 A0A0G2JND7 137 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 TP53I11O14683 189 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 HDAC3O15379 428 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 ATE1O95260 518 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 EPPINO95925 133 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 IGKV3-11P04433 115 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 JUNP05412 331 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 HEXAP06865 529 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 FGF4P08620 206 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 AQP5P55064 265 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 RPL38P63173 70 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 RPP38P78345 283 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 C2orf80Q0P641 193 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 LTB4RQ15722 352 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 PIGGQ5H8A4 983 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 VWA5B2Q8N398 1253 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 PAQR8Q8TEZ7 354 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 ZNF597Q96LX8 424 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 SMR3AQ99954 134 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 DOHHQ9BU89 302 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 CXorf21Q9HAI6 301 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 LRTM1Q9HBL6 345 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 SERTM1A2A2V5 107 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 GOLGA8OA6NCC3 632 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 TRPC5OSA6NMA1 111 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 GOLGA8NF8WBI6 632 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 PIP5K1BO14986 540 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 SNX3O60493 162 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 CELA3AP09093 270 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 GDF1P27539 372 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 PIGAP37287 484 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 TMED10P49755 219 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 ARFIP2P53365 341 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 SLC37A1P57057 533 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 DCAF7P61962 342 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 DUSP2Q05923 314 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms