RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa4.14□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 DHRS7Q9Y394 339 aa4.14□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa4.14□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TEX264Q9Y6I9 313 aa4.14□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa4.14□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRBAP50851 2863 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MED12Q93074 2177 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCHS2Q6V1P9 2916 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1B0GVC2 190 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPIPB13A6NJU9 1138 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 VSTM2BA6NLU5 285 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPIPB5A8MRT5 1133 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPIPB4C9JG80 1138 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC188H7C350 402 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 GFYI3L273 518 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLGNO14967 610 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TP73O15350 636 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR1F1O43749 312 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SH3BGRLO75368 114 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUDT3O95989 172 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 HPP00738 406 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 C8orf89P0DMQ9 161 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 LYL1P12980 280 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 BMP5P22003 454 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CXCR2P25025 360 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 EMP2P54851 167 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC12A2P55011 1212 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ELLP55199 621 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAS2R39P59534 338 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB8AP61006 207 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TUBA4AP68366 448 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSNK1G2P78368 415 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARG2P78540 354 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 REEP5Q00765 189 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CALCOCO2Q13137 446 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABRAXAS2Q15018 415 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NDUFA9Q16795 377 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP1R3AQ16821 1122 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 STEAP4Q687X5 459 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 UGT3A1Q6NUS8 523 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRMT9Q6P2P2 845 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM88Q6PEY1 159 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 LCTLQ6UWM7 567 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM207Q6UWW9 146 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYHR1Q6ZMK1 362 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF788Q6ZQV5 615 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CMC1Q7Z7K0 106 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCGF5Q86SE9 256 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC26A11Q86WA9 606 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEP97Q8IW35 865 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 LMNTD2Q8IXW0 634 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZADH2Q8N4Q0 377 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNX31Q8N9S9 440 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM47BQ8NA70 645 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MCOLN3Q8TDD5 553 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD49Q8WVL7 239 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC5A11Q8WWX8 675 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TM9SF4Q92544 642 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLCO2A1Q92959 643 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NEIL2Q969S2 332 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZUFSPQ96AP4 578 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 RUNDC3BQ96NL0 473 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 AGAP4Q96P64 663 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 IP6K3Q96PC2 410 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2A5Q96R48 311 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4K3Q96R72 315 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAT9Q9BTE0 207 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 HDHD5Q9BXW7 423 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 LHPPQ9H008 270 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC26A1Q9H2B4 701 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PARVBQ9HBI1 364 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKHQ9HCJ1 492 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMYD2Q9NRG4 433 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 C14orf105Q9NVL8 296 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLK4Q9Y5K2 254 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 DOCK7Q96N67 2140 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAGEB16A2A368 324 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKUB1A6NFN9 424 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 A8MUA0 341 aa4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms