RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 TTC26A0AVF1 554 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 FRG2CA6NGY1 282 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 H0YL77 283 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 SSX5O60225 188 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 SLC2A10O95528 541 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 TGFAP01135 160 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 SDC1P18827 310 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 PTPN6P29350 595 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ACVR1BP36896 505 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 FUT7Q11130 342 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ZP4Q12836 540 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 IL18R1Q13478 541 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ASAH1Q13510 395 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 PDIA5Q14554 519 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 LGSNQ5TDP6 509 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ZNF562Q6V9R5 426 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 HACD2Q6Y1H2 254 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 PAQR9Q6ZVX9 377 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 CCDC36Q8IYA8 594 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 KDM8Q8N371 416 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ZNF525Q8N782 197 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 RNF148Q8N7C7 305 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 SAMD8Q96LT4 415 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 HCAR1Q9BXC0 346 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 NINJ2Q9NZG7 142 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 KLRF1Q9NZS2 232 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 P2RX2Q9UBL9 471 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 UBE4BO95155 1302 aa3.12□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 KRT87PA6NCN2 255 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 LGALS8O00214 317 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 SEC22BO75396 215 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 GAP43P17677 238 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 XCR1P46094 333 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 HTR5AP47898 357 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 MEOX2P50222 304 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ERVPABLB-1P60509 514 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 IL9RQ01113 521 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 PUDPQ08623 228 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 FHL5Q5TD97 284 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 SLX4IPQ5VYV7 408 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 SLC39A4Q6P5W5 647 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ZNF619Q8N2I2 560 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 MINDY2Q8NBR6 621 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 OR56B1Q8NGI3 324 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 CCDC26Q8TAB7 109 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ART4Q93070 314 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 MCHR2Q969V1 340 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 NCLNQ969V3 563 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 TADA1Q96BN2 335 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 VSIG2Q96IQ7 327 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 PAXXQ9BUH6 204 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 SOHLH2Q9NX45 425 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 CLEC4EQ9ULY5 219 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 GPRASP1Q5JY77 1395 aa3.11□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 KLLNB2CW77 178 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 SLC17A2O00624 439 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 HAT1O14929 419 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ALOX15BO15296 676 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 NOL4O94818 638 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 NDUFA7O95182 113 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 RPA1P27694 616 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 RPS6P62753 249 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 NDPQ00604 133 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 CD47Q08722 323 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 UBE2V2Q15819 145 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 MEDAGQ5VYS4 303 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 SLC22A10Q63ZE4 541 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 OLFML2AQ68BL7 652 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 IRGCQ6NXR0 463 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 LEG1Q6P5S2 330 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 Q7L0L9 218 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 SH2D6Q7Z4S9 175 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 PARGQ86W56 976 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 MCOLN2Q8IZK6 566 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 OR8H1Q8NGG4 311 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 BADQ92934 168 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 SLC25A36Q96CQ1 311 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 FAM111AQ96PZ2 611 aa3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.7 ms