RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 PDZK1P1A8MUH7 402 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 APOL3O95236 402 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 URODP06132 367 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 H1F0P07305 194 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ALOX12P18054 663 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMB5P28074 263 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PNLIPRP1P54315 467 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP4F2P78329 520 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SPIBQ01892 262 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PDZK1Q5T2W1 519 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5H6Q8NGV6 325 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CAPSLQ8WWF8 208 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TIFAQ96CG3 184 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MED30Q96HR3 178 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TPD52L3Q96J77 140 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TOX2Q96NM4 488 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DHRS9Q9BPW9 319 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 EGLN3Q9H6Z9 239 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SPC25Q9HBM1 224 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NANSQ9NR45 359 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MYO15AQ9UKN7 3530 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR6C65A6NJZ3 312 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KPNA5O15131 536 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LYRM1O43325 122 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SMIM10L1P0DMW3 83 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NNMTP40261 264 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB43Q86YS6 212 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5AR1Q8NGP9 310 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 C16orf58Q96GQ5 468 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SMIM10Q96HG1 83 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNS3Q9BQ31 491 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LGR4Q9BXB1 951 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXL4Q9UKA2 621 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ATG4BQ9Y4P1 393 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MYO9BQ13459 2157 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ABHD16AO95870 558 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ASGR2P07307 311 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ADRA2CP18825 462 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CD53P19397 219 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MST1P26927 711 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS15P62841 145 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DEFB103AP81534 67 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SCN1BQ07699 218 aa3.39□□□□□ -1.87
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PGGT1B-203ENST00000419445 MED27Q6P2C8 311 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ABHD17CQ6PCB6 329 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HORMAD1Q86X24 394 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF680Q8NEM1 530 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFPM2Q8WW38 1151 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5P2Q8WZ92 322 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MS4A6EQ96DS6 147 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LRIG1Q96JA1 1093 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZSWIM3Q96MP5 696 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CNPPD1Q9BV87 410 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HAO2Q9NYQ3 351 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NLKQ9UBE8 527 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXL3Q9UKT7 428 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MPDZO75970 2070 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 A6NCN8 305 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MGAT4DA6NG13 374 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CASC3O15234 703 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
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PGGT1B-203ENST00000419445 NFE2L1Q14494 772 aa3.38□□□□□ -1.87
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PGGT1B-203ENST00000419445 UAP1L1Q3KQV9 507 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TOR2AQ5JU69 321 aa3.38□□□□□ -1.87
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PGGT1B-203ENST00000419445 HBMQ6B0K9 141 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM166AQ6J272 317 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM40Q6P9F5 258 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SYTL1Q8IYJ3 562 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2L2Q8NH16 312 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 IRF7Q92985 503 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CREB3L1Q96BA8 519 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TM7SF3Q9NS93 570 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CA5BQ9Y2D0 317 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LRIT2A6NDA9 550 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PRRG1O14668 218 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FRS3O43559 492 aa3.38□□□□□ -1.87
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