RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM83CQ9BQN1 747 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 SH2B3Q9UQQ2 575 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 C2orf74A8MZ97 194 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 KCNJ13O60928 360 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 ADAMTS4O75173 837 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 GASTP01350 101 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 ACP2P11117 423 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 GP1BBP13224 206 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 LHCGRP22888 699 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC7A9P82251 487 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 FGFBP1Q14512 234 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 RAB12Q6IQ22 244 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 FIGNL1Q6PIW4 674 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 KIF18BQ86Y91 864 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 OR52E2Q8NGJ4 325 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 COQ8AQ8NI60 647 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 MS4A4EQ96PG1 132 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 NPAP1Q9NZP6 1156 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 B4DGG1 531 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 KLK8O60259 260 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 CLEC3AO75596 197 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 TIMP2P16035 220 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 ARHGDIBP52566 201 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 HORMAD2Q8N7B1 307 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 MBOAT4Q96T53 435 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 ARL6Q9H0F7 186 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 DUSP21Q9H596 190 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 HYKKA2RU49 373 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 SCG5P05408 212 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 CTSAP10619 480 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 MASP1P48740 699 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 GP2P55259 537 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 TATDN3Q17R31 274 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 GARNL3Q5VVW2 1013 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.072e-9■■■■□ 21.9
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 FTMTQ8N4E7 242 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 LINC00597Q9H2U6 94 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 FRS3O43559 492 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 IMPA1P29218 277 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 GRIN2CQ14957 1233 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC29A4Q7RTT9 530 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 OR4N5Q8IXE1 308 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 RNF186Q9NXI6 227 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR34Q9UPC5 381 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 A8MU76 341 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 CCL5P13501 91 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 PGAM2P15259 253 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 MC3RP41968 323 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 ILKQ13418 452 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 CADM3Q8N126 398 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 PXYLP1Q8TE99 480 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 TXNDC15Q96J42 360 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 SNX18Q96RF0 628 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 KLHL9Q9P2J3 617 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 CACNG2Q9Y698 323 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A1W2PQU0 124 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 CYB5AP00167 134 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 DRD5P21918 477 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 IGFBP4P22692 258 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 ART1P52961 327 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 ALG10BQ5I7T1 473 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 SPATC1Q76KD6 591 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC39A11Q8N1S5 342 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 DPH1Q9BZG8 443 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 C11orf49Q9H6J7 331 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 RXFP3Q9NSD7 469 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 NDUFAF4Q9P032 175 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 HS3ST2Q9Y278 367 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 RFPL3O75679 317 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 KAT7O95251 611 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 CBLP22681 906 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 HYAL2Q12891 473 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 RIMKLAQ8IXN7 391 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 OR8S1Q8NH09 359 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 OR4K13Q8NH42 304 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 OR5W2Q8NH69 310 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.073e-7■□□□□ 11
CTDSP2-201ENST00000398073 TAS2R8Q9NYW2 309 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 KLHL21Q9UJP4 597 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDSP2-201ENST00000398073 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms