RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356020.2

LINC01565-201, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1565, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC01565, Length 2,697 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565-201ENST00000356020 TATDN3Q17R31 274 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 TMEM35AQ53FP2 167 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 RAB42Q8N4Z0 105 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 DUSP18Q8NEJ0 188 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 TTLQ8NG68 377 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 CLIP3Q96DZ5 547 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 TM9SF2Q99805 663 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 GPR52Q9Y2T5 361 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 A0A1W2PQ72 361 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 WASHC1A8K0Z3 465 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 LRRTM2O43300 516 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 OR2B3O76000 313 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 CLCNKAP51800 687 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 PPP3R1P63098 170 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 FABP5Q01469 135 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 ESCO2Q56NI9 601 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 WASH2PQ6VEQ5 465 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 GJD3Q8N144 294 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 OR56A1Q8NGH5 318 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 ARHGDIGQ99819 225 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 PHF11Q9UIL8 331 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC01565-201ENST00000356020 MYO10Q9HD67 2058 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 SMIM30A4D0T7 59 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 B8ZZF3 427 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 CSF2P04141 144 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 FHP07954 510 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 PRKAR1AP10644 381 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 PTGER1P34995 402 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 P2RY2P41231 377 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 ZNF234Q14588 700 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 NUMA1Q14980 2115 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 TRAM2Q15035 370 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 UAP1L1Q3KQV9 507 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 TRIQKQ629K1 86 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 ZNF485Q8NCK3 441 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 C19orf18Q8NEA5 215 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 MOAP1Q96BY2 351 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 LGR4Q9BXB1 951 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 B3GNT2Q9NY97 397 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 ALG5Q9Y673 324 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 GLOD5A6NK44 160 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 ALPPL2P10696 532 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 EPCAMP16422 314 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 SLC9A5Q14940 896 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 BTBD16Q32M84 506 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 IDO2Q6ZQW0 420 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 SHFQ7M4L6 423 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 RSPRY1Q96DX4 576 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 KCNN3Q9UGI6 736 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 CD79BP40259 229 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 SLC1A3P43003 542 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 CDH11P55287 796 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 HOXC5Q00444 222 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 MAB21L1Q13394 359 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 ZIC1Q15915 447 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 POGLUT1Q8NBL1 392 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 DIO2Q92813 273 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 RAB7BQ96AH8 199 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 KLHL31Q9H511 634 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 SLC13A4Q9UKG4 626 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 ENTPD4Q9Y227 616 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 SSTR4P31391 388 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 CLDN20P56880 219 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 DUSP2Q05923 314 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 TMEM44Q2T9K0 475 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 ZNF311Q5JNZ3 666 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 C16orf58Q96GQ5 468 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 FERD3LQ96RJ6 166 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 COQ7Q99807 217 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 HDAC8Q9BY41 377 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 SEMA4GQ9NTN9 838 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 CNIH4Q9P003 139 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 DEC1Q9P2X7 70 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC01565-201ENST00000356020 ACSL5Q9ULC5 683 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms