RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344376.9

ATG4B-201, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 1,566 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-201ENST00000344376 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 RNF6Q9Y252 685 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 ACTL7BQ9Y614 415 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 TSPAN2O60636 221 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 PSMG1O95456 288 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 PSG6Q00889 435 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 PDE7AQ13946 482 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 33.4
ATG4B-201ENST00000344376 CDSNQ15517 529 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 CHI3L2Q15782 390 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 PM20D2Q8IYS1 436 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 KIRREL3Q8IZU9 778 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 FNDC5Q8NAU1 212 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 OR6Y1Q8NGX8 325 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 NTNG2Q96CW9 530 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 PGM2Q96G03 612 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 TTYH2Q9BSA4 534 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 CBLCQ9ULV8 474 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 MAPRE3Q9UPY8 281 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 WIF1Q9Y5W5 379 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 EML6Q6ZMW3 1958 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 CBR3O75828 277 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 PRPS2P11908 318 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 GRK2P25098 689 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 ARRB2P32121 409 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 PTGDSP41222 190 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 VPS26BQ4G0F5 336 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 SZRD1Q7Z422 152 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 PLCZ1Q86YW0 608 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 ULK2Q8IYT8 1036 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 OR4N2Q8NGD1 307 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 CEP70Q8NHQ1 597 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 TUBGCP3Q96CW5 907 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 SERHLQ9NQF3 203 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 FAM215AQ9Y5M1 114 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF407Q9C0G0 2248 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 C2orf72A6NCS6 295 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 FAM90A27PA6NNH2 459 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 GLI4P10075 376 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 EIPR1Q53HC9 387 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF385BQ569K4 471 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 MCEMP1Q8IX19 187 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 C1orf50Q9BV19 199 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 KCNJ16Q9NPI9 418 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 EQTNQ9NQ60 294 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 ATAD3AQ9NVI7 634 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 GIMAP2Q9UG22 337 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 SLC6A5Q9Y345 797 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 CENPEQ02224 2701 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 EXPH5Q8NEV8 1989 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 AHRRA9YTQ3 701 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 KCNH1O95259 989 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 FRKP42685 505 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 CLK3P49761 638 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 PRKAG1P54619 331 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 NHSL2Q5HYW2 709 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 C6orf136Q5SQH8 315 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 IL23RQ5VWK5 629 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 RTL6Q6ICC9 239 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 OR14L1PQ8NHC6 308 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 C3orf30Q96M34 536 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 MS4A4EQ96PG1 132 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 TIMP4Q99727 224 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 PRDM4Q9UKN5 801 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 CAMK2AQ9UQM7 478 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 NOTCH2Q04721 2471 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 DNAJC13O75165 2243 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 EMC8O43402 210 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 IL33O95760 270 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 ACTL6AO96019 429 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 DHRS4L1P0CG22 281 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 CYP4B1P13584 511 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 EVI2BP34910 448 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms