RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 AKAP14Q86UN6 197 aa16.5■□□□□ 0.23
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SPNS1-202ENST00000323081 EGLN3Q9H6Z9 239 aa16.5■□□□□ 0.23
SPNS1-202ENST00000323081 SEMA4GQ9NTN9 838 aa16.5■□□□□ 0.23
SPNS1-202ENST00000323081 KCMF1Q9P0J7 381 aa16.5■□□□□ 0.23
SPNS1-202ENST00000323081 CHST2Q9Y4C5 530 aa16.5■□□□□ 0.23
SPNS1-202ENST00000323081 PEX16Q9Y5Y5 336 aa16.5■□□□□ 0.23
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SPNS1-202ENST00000323081 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.23
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SPNS1-202ENST00000323081 FIGLAQ6QHK4 219 aa16.48■□□□□ 0.23
SPNS1-202ENST00000323081 TRIM48Q8IWZ4 208 aa16.48■□□□□ 0.23
SPNS1-202ENST00000323081 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
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SPNS1-202ENST00000323081 OR52I1Q8NGK6 324 aa16.48■□□□□ 0.23
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