RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHST2Q9Y4C5 530 aa20.37■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MMACHCQ9Y4U1 282 aa20.37■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STX11O75558 287 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 THBS1P07996 1170 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HLCSP50747 726 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERV3-1Q14264 604 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PERM1Q5SV97 790 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HMGN2P46Q86SG4 172 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PEX5LQ8IYB4 626 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR9Q2Q8NGE9 314 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NAT6Q93015 286 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HRASLS5Q96KN8 279 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APOL4Q9BPW4 351 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NDC1Q9BTX1 674 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF556Q9HAH1 456 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ENOPH1Q9UHY7 261 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC13A4Q9UKG4 626 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MKLN1Q9UL63 735 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMCC3Q9ULS5 477 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GMPPBQ9Y5P6 360 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NCOR1O75376 2440 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CPED1A4D0V7 1026 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AGAP5A6NIR3 686 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A8MU76 341 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAAHO00519 579 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UGT2B17O75795 530 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CPNE6O95741 557 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GUSBP08236 651 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EPHA2P29317 976 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DSG2Q14126 1118 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NPTX1Q15818 432 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C6orf141Q5SZD1 244 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF619Q8N2I2 560 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPR151Q8TDV0 419 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FANCEQ9HB96 536 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLHL28Q9NXS3 571 aa20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DSCR3O14972 297 aa20.35■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIAA0513O60268 411 aa20.35■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CER1O95813 267 aa20.35■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAOAP21397 527 aa20.35■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CRHBPP24387 322 aa20.35■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EMDP50402 254 aa20.35■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDH15P55291 814 aa20.35■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPP38P78345 283 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FGD3Q5JSP0 725 aa20.35■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCST1Q5T197 706 aa20.35■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC23A3Q6PIS1 610 aa20.35■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FGF21Q9NSA1 209 aa20.35■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC6A14Q9UN76 642 aa20.35■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF232Q9UNY5 417 aa20.35■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAU2Q9Y6X3 613 aa20.35■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MUC3AQ02505 3323 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BDP1A6H8Y1 2624 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR6B1O95007 311 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADAP00813 363 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALDH3B2P48448 385 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FUT7Q11130 342 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MEP1AQ16819 746 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF528Q3MIS6 628 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LAIR2Q6ISS4 152 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AQP11Q8NBQ7 271 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C7orf57Q8NEG2 295 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR4D9Q8NGE8 314 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIK3R3Q92569 461 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF566Q969W8 418 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DPYSL5Q9BPU6 564 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FNDC11Q9BVV2 318 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FOLH1BQ9HBA9 442 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A1W2PQM1 296 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRAMEF2O60811 474 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL7RP16871 459 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALAS2P22557 587 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GABRA3P34903 492 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR1D4P47884 311 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUP107P57740 925 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GABARAPL2P60520 117 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSG6Q00889 435 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDK5R2Q13319 367 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEC23BQ15437 767 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EIPR1Q53HC9 387 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCNJQ5T5M9 372 aa20.34■□□□□ 0.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BORAQ6PGQ7 559 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms