RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 LGI1O95970 557 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ALOX5P09917 674 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 THRBP10828 461 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ITGA2P17301 1181 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 RHCEP18577 417 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 FBLP22087 321 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 PIGAP37287 484 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 MYBPC1Q00872 1141 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 GANABQ14697 944 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 QSOX2Q6ZRP7 698 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 USP51Q70EK9 711 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 OR52J3Q8NH60 311 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 VSTM2LQ96N03 204 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF350Q9GZX5 532 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 TOR3AQ9H497 397 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 GALNT8Q9NY28 637 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 RHCGQ9UBD6 479 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 CTSFQ9UBX1 484 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNE5Q9UJ90 142 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ADAMDEC1O15204 470 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 HS6ST1O60243 411 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 NKX2-2O95096 273 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 GABRA3P34903 492 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 CAPGP40121 348 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 HMGA2P52926 109 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 CDH12P55289 794 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 SERTAD2Q14140 314 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 MINDY4Q4G0A6 757 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 DCST2Q5T1A1 773 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 PHF19Q5T6S3 580 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 KDM4DQ6B0I6 523 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 FAHD1Q6P587 224 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 DHRSXQ8N5I4 330 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF615Q8N8J6 731 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 OR6T1Q8NGN1 323 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 CYGBQ8WWM9 190 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 FOLH1BQ9HBA9 442 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 CALML5Q9NZT1 146 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 SATB2Q9UPW6 733 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ERVK-19Q9WJR5 959 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 MMACHCQ9Y4U1 282 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 CLDN24A6NM45 220 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 TNFRSF11BO00300 401 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ACP1P24666 158 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 GALNSP34059 522 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 PGDP52209 483 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 CHN2P52757 468 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 SPIBQ01892 262 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 NPTX1Q15818 432 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 MAPK14Q16539 360 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGAP40Q5TG30 622 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ZAR1Q86SH2 424 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF321PQ8N8H1 164 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 OR4N2Q8NGD1 307 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR151Q8TDV0 419 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 CNPPD1Q9BV87 410 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 SAP130Q9H0E3 1048 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 RLIMQ9NVW2 624 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 SCOCQ9UIL1 159 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ACAD8Q9UKU7 415 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 SRPK3Q9UPE1 567 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR45Q9Y484 360 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 MAGEA13PA6NCF6 341 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDH17O14917 1159 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 TPST2O60704 377 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 COQ9O75208 318 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 SCRG1O75711 98 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 IFNA16P05015 189 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 MYF6P23409 242 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF311Q5JNZ3 666 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 NPSR1Q6W5P4 371 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 CLIP4Q8N3C7 705 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 COX18Q8N8Q8 333 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 BMPERQ8N8U9 685 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 C16orf52Q8NHV5 167 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 RDH12Q96NR8 316 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 PINK1Q9BXM7 581 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 VN1R1Q9GZP7 353 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 RARRES3Q9UL19 164 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 A4GNTQ9UNA3 340 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC160A6NGH7 325 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms