RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283875.5

GTF2E1-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E1, Length 3,012 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1-201ENST00000283875 ERCC2P18074 760 aa6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 ETV5P41161 510 aa6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 CD86P42081 329 aa6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 CRATP43155 626 aa6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 FKBP1BP68106 108 aa6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 RBBP4Q09028 425 aa6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 TPBGQ13641 420 aa6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 HNF4GQ14541 408 aa6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 GCNT6Q5T4J0 391 aa6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 SYPL2Q5VXT5 272 aa6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 MZT2AQ6P582 158 aa6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 SLAMF9Q96A28 289 aa6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 SEC11CQ9BY50 192 aa6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 REEP1Q9H902 201 aa6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 GJD2Q9UKL4 321 aa6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 CBLCQ9ULV8 474 aa6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 NOD1Q9Y239 953 aa6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 ANKRD36A6QL64 1941 aa6.96□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 A0A1B0GTL3 188 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 A0A1W2PPE3 182 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 BTBD17A6NE02 478 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 NUDT19A8MXV4 375 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 MED6O75586 246 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 TOXO94900 526 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 NFATC1O95644 943 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 FGF19O95750 216 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 PFKMP08237 780 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 LINC00614P0C842 121 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 RPA2P15927 270 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 PKIAP61925 76 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 NHLH2Q02577 135 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 ABHD18Q0P651 414 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 DUSP28Q4G0W2 176 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 C22orf42Q6IC83 251 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM207Q6UWW9 146 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 Q6ZSR9 355 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 BEST4Q8NFU0 473 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 OR4C15Q8NGM1 316 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 RAB24Q969Q5 203 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 ZFP42Q96MM3 310 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 NFKBIZQ9BYH8 718 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 NTMQ9P121 344 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 ZAR1LA6NP61 321 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF879B4DU55 563 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 H0YCG3 227 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 PSMD3O43242 534 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 TXNL1O43396 289 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 RDH16O75452 317 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 ANXA9O76027 345 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 MLYCDO95822 493 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 UBBP0CG47 229 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 PTPN6P29350 595 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 EPHB3P54753 998 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 UBA52P62987 128 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 MBTD1Q05BQ5 628 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 ITKQ08881 620 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 SREBF2Q12772 1141 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 NOGQ13253 232 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 CTBP1Q13363 440 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 GTF2H3Q13889 308 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 PEA15Q15121 130 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 MORN1Q5T089 497 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 CBLL1Q75N03 491 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 C10orf111Q8N326 155 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms