RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 LplP11152 474 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Folr1P35846 255 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kcna7Q17ST2 489 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Crhr2Q60748 411 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cntn2Q61330 1040 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Osgepl1Q6PEB4 414 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc26a11Q80ZD3 593 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cst13Q80ZN5 141 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GalpQ810H5 117 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Timmdc1Q8BUY5 285 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gulp1Q8K2A1 304 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tsen15Q8R3W5 168 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem106aQ8VC04 261 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mrgprb4Q91ZC0 321 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dnase1l1Q9D7J6 314 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 NfkbizQ9EST8 728 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Casp8ap2Q9WUF3 1962 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trav1A0A075B5Z4 110 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm6133B2RY53 190 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sult6b2B7ZWN4 290 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm8220F6YKI2 213 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 2610008E11RikG3X964 669 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Man2b1O09159 1013 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc7a2P18581 657 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mmp12P34960 473 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc9a3r1P70441 355 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 VaspP70460 375 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rad51Q08297 339 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fbxl19Q6PB97 674 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trpv1Q704Y3 839 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plekhm3Q8BM47 761 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Bbs4Q8C1Z7 520 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Anapc10Q8K2H6 185 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hus1bQ8K572 276 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1226Q8VGM5 310 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 NansQ99J77 359 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmed9Q99KF1 235 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ms4a10Q99N03 267 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cxxc1Q9CWW7 660 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pex13Q9D0K1 405 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr701Q9D3U9 316 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tex19.2Q9D5S1 317 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ift46Q9DB07 301 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AicdaQ9WVE0 198 aa9.4□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm5483B2RV77 97 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm8765B7ZWJ3 1017 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 OgdhlE9Q7L0 1029 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tssk2O54863 358 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lancl1O89112 399 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hmga1P17095 107 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 FpgsP48760 587 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hnf4aP49698 474 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hrh3P58406 445 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sec24aQ3U2P1 1090 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ctu2Q3U308 514 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam196aQ3USH1 422 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm906Q3V0M1 1017 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ctf1Q60753 203 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HpQ61646 347 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ffar1Q76JU9 300 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr735Q7TRM4 354 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 B3galnt2Q8BG28 504 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem220Q8BP07 167 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ZxdcQ8C8V1 858 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 RfkQ8CFV9 155 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Crispld1Q8CGD2 500 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Piwil4Q8CGT6 848 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TifabQ8JZM6 147 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Oas1gQ8K469 367 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr693Q8VF89 316 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr572Q8VGZ3 318 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 B3galnt1Q920V1 331 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Emc3Q99KI3 261 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cmtm3Q99LJ5 184 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trmt5Q9D0C4 501 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dimt1Q9D0D4 313 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sohlh2Q9D489 467 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam69aQ9D6I7 428 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Msgn1Q9JK54 188 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Acss2Q9QXG4 701 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdc42ep5Q9Z0X0 150 aa9.4□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp994J3QM38 661 aa9.39□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp616J3QN14 987 aa9.39□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1249L7MU51 318 aa9.39□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hes2O54792 157 aa9.39□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kcnj15O88932 375 aa9.39□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CryaaP24622 196 aa9.39□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Stard6P59096 233 aa9.39□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tekt4Q149S1 447 aa9.39□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nlrc3Q5DU56 1064 aa9.39□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ltc4sQ60860 150 aa9.39□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Elfn2Q68FM6 823 aa9.39□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q6PAC4 1279 aa9.39□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr128Q7TRJ1 308 aa9.39□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fbxo5Q7TSG3 421 aa9.39□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc39a9Q8BFU1 308 aa9.39□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdkl3Q8BLF2 595 aa9.39□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 E330021D16RikQ8BW45 371 aa9.39□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spp2Q8K1I3 203 aa9.39□□□□□ -0.91
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r18Q8R2C8 299 aa9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.5 ms