RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599236.5

FCHO1-228, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-228ENST00000599236 TO15178 435 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 KLF4O43474 513 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 TSPAN2O60636 221 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 CDH16O75309 829 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 REM1O75628 298 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 C2P06681 752 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 GFAPP14136 432 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 TCP1P17987 556 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 DRD5P21918 477 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 CRABP2P29373 138 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 SRD5A2P31213 254 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 PPICP45877 212 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 CORO7P57737 925 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 PPP2R2BQ00005 443 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 SGO1Q5FBB7 561 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 SLC48A1Q6P1K1 146 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 OR4N2Q8NGD1 307 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 OR5M1Q8NGP8 315 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 FBF1Q8TES7 1133 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 RNF138Q8WVD3 245 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 CDKL2Q92772 493 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 ADOQ96SZ5 270 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 SERPINI1Q99574 410 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 GSX2Q9BZM3 304 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 RTN4RQ9BZR6 473 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 GRHL1Q9NZI5 618 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 CR1P17927 2039 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 UGDHO60701 494 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 CRLF1O75462 422 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 SEMA3DO95025 777 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 CLDN9O95484 217 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 ATP1B1P05026 303 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 CT45A8P0DMV1 189 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 CT45A9P0DMV2 189 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 FPR1P21462 350 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 CHMP24386 653 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 TNK1Q13470 666 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 CT45A2Q5DJT8 189 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 NPSR1Q6W5P4 371 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 COMMD6Q7Z4G1 85 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 P4HA3Q7Z4N8 544 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 UBQLNLQ8IYU4 475 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 METTL4Q8N3J2 472 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 RHEBL1Q8TAI7 183 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 REPS1Q96D71 796 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 COL21A1Q96P44 957 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF226Q9NYT6 803 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 FLRT3Q9NZU0 649 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 ACOT9Q9Y305 439 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF337Q9Y3M9 751 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 OR6C70A6NIJ9 312 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 SLC22A20A6NK97 555 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 C16orf97H3BN30 126 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 ACOX3O15254 700 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 POU2F1P14859 743 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 GRK2P25098 689 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 DPP4P27487 766 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 GCKP35557 465 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 PCYT1AP49585 367 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 PHEXP78562 749 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 TRAF3Q13114 568 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 MROH9Q5TGP6 573 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 AAGABQ6PD74 315 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 FNDC9Q8TBE3 224 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 KAT2AQ92830 837 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 PHF21BQ96EK2 531 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 SLC35A4Q96G79 324 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 ACBD3Q9H3P7 528 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 DSN1Q9H410 356 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 FRG2CA6NGY1 282 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 SYCE1LA8MT33 242 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 SOX30O94993 753 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 CRHP06850 196 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 DEKP35659 375 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 MAPK12P53778 367 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 CLDN20P56880 219 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 GUSBP1Q15486 140 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 BCL2A1Q16548 175 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 PRSS53Q2L4Q9 553 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF628Q5EBL2 1059 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 FRG2Q64ET8 278 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 C20orf204Q6ZNR8 217 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-228ENST00000599236 CCDC116Q8IYX3 515 aa12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms