RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597400.5

ZNF548-207, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ZNF548, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-207ENST00000597400 GPX6P59796 221 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 PGGHGQ32M88 737 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 FAM219BQ5XKK7 198 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 ADAM5Q6NVV9 412 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 FAM214BQ7L5A3 538 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 NUDT13Q86X67 352 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 FADS6Q8N9I5 356 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 SPC24Q8NBT2 197 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 OR4K14Q8NGD5 310 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 UBTD2Q8WUN7 234 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 SLC35A4Q96G79 324 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 UBXN10Q96LJ8 280 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 COL21A1Q96P44 957 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 ATOH8Q96SQ7 321 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 RTN4RQ9BZR6 473 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 BRINP2Q9C0B6 783 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 ACTR6Q9GZN1 396 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 ALG9Q9H6U8 611 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 WDR41Q9HAD4 459 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 ASIC3Q9UHC3 531 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 BCAP29Q9UHQ4 241 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 CES1P1Q9UKY3 287 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 ZNF337Q9Y3M9 751 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 H3BML4 177 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 TO15178 435 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 ACOX3O15254 700 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 TSPAN2O60636 221 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 TNFRSF21O75509 655 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 CD8AP01732 235 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 PEPDP12955 493 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 PORP16435 677 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 FNTAP49354 379 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 CORO7P57737 925 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 MAP4K2Q12851 820 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 FAPQ12884 760 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 CUL3Q13618 768 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 PPP1R7Q15435 360 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 TMEM249Q2WGJ8 235 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 RAET1LQ5VY80 246 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 NPSR1Q6W5P4 371 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 IL17RELQ6ZVW7 336 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 CHMP1BQ7LBR1 199 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 GGNQ86UU5 652 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 TEX9Q8N6V9 391 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 KBTBD8Q8NFY9 601 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 TRIM58Q8NG06 486 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 OR52R1Q8NGF1 315 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 WDR20Q8TBZ3 569 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 FBXW5Q969U6 566 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 ADOQ96SZ5 270 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 FLRT3Q9NZU0 649 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 OPTCQ9UBM4 332 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 ZNF175Q9Y473 711 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 RNF115Q9Y4L5 304 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 OR2M5A3KFT3 312 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 SUPT3HB4E1H0 165 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 SHISA8B8ZZ34 492 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 H0YIV9 168 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 CLOCKO15516 846 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 SUPT3HO75486 399 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 REM1O75628 298 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 ATP1B1P05026 303 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 CT45A8P0DMV1 189 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 CT45A9P0DMV2 189 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 MTHFD2P13995 350 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 PPP3CBP16298 524 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 PCSK2P16519 638 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 DRD5P21918 477 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 FEN1P39748 380 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 PPICP45877 212 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 ATP6V0D1P61421 351 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 POU4F1Q01851 419 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 TSC22D1Q15714 1073 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 CT45A2Q5DJT8 189 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 C6orf163Q5TEZ5 329 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 ALKBH2Q6NS38 261 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 SLC48A1Q6P1K1 146 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 ZNF662Q6ZS27 426 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 MILR1Q7Z6M3 343 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 ISCA2Q86U28 154 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-207ENST00000597400 PDIK1LQ8N165 341 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms