RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575783.5

CTDNEP1-211, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-211ENST00000575783 GUSBP1Q15486 140 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 SGCBQ16585 318 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 GRHL2Q6ISB3 625 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 PDPRQ8NCN5 879 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ROBO4Q8WZ75 1007 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 MS4A14Q96JA4 679 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ADOQ96SZ5 270 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 PRRG4Q9BZD6 226 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CAB39LQ9H9S4 337 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 POPDC3Q9HBV1 291 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMEM160Q9NX00 188 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 PLLPQ9Y342 182 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 EMC9Q9Y3B6 208 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR6C70A6NIJ9 312 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 B4DXG7 233 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 H3BML4 177 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 CD3EP07766 207 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 CD1DP15813 335 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 SRD5A1P18405 259 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 HK1P19367 917 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 DRD5P21918 477 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 THBS2P35442 1172 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 ARFIP1P53367 373 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 CTBP2P56545 445 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 MGAT5Q09328 741 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 MGAT2Q10469 447 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLMAPQ14BN4 828 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 PPP1R7Q15435 360 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 NUDT13Q86X67 352 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR6K3Q8NGY3 331 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 DSN1Q9H410 356 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 ALG2Q9H553 416 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 FANCFQ9NPI8 374 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 OPTCQ9UBM4 332 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 K7EPI3 171 aa14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 THBS1P07996 1170 aa14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 FEN1P39748 380 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 PPICP45877 212 aa14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 PHEXP78562 749 aa14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 MAP4K2Q12851 820 aa14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 PGGHGQ32M88 737 aa14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 IL17RELQ6ZVW7 336 aa14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR52R1Q8NGF1 315 aa14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 FOLH1BQ9HBA9 442 aa14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 ASIC3Q9UHC3 531 aa14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 GPR52Q9Y2T5 361 aa14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 FCGR2AP12318 317 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 PTNP21246 168 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLC6A8P48029 635 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 ATP6V0D1P61421 351 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 VLDLRP98155 873 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF844Q08AG5 666 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 CUL3Q13618 768 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 NCMAPQ5T1S8 102 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 STEAP4Q687X5 459 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 CYB5R2Q6BCY4 276 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 BEND4Q6ZU67 534 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 PDIK1LQ8N165 341 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF619Q8N2I2 560 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 TEX9Q8N6V9 391 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 S100PBPQ96BU1 408 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 RHOJQ9H4E5 214 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 SMYD2Q9NRG4 433 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 MAT2BQ9NZL9 334 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 A0A096LNT2 108 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR2M5A3KFT3 312 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 TO15178 435 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 PIAS1O75925 651 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 CBX7O95931 251 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 CD8AP01732 235 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDNEP1-211ENST00000575783 KLK1P06870 262 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.4 ms