RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	NXNL1	Q96CM4	212 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	MED30	Q96HR3	178 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	C3orf30	Q96M34	536 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	RUFY1	Q96T51	708 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CMKLR1	Q99788	373 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	FGF22	Q9HCT0	170 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	COPG2	Q9UBF2	871 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ACOT9	Q9Y305	439 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	DHRS7	Q9Y394	339 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	NCOR1	O75376	2440 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	KNL1	Q8NG31	2342 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM120B	A0PK00	339 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	MGAT4D	A6NG13	374 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	MEI4	A8MW99	385 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934		H3BMM5	538 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	TLR4	O00206	839 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CDC7	O00311	574 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	HCRTR2	O43614	444 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB14	O43829	449 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	VEGFD	O43915	354 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	VPS26A	O75436	327 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	GPC4	O75487	556 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	KDM4B	O94953	1096 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	SLCO2B1	O94956	709 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	KLHL2	O95198	593 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	TSPAN12	O95859	305 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	OR56A5	P0C7T3	313 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC166	P0CW27	439 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	THEGL	P0DJG4	465 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CD1D	P15813	335 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CRABP2	P29373	138 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	PDHA2	P29803	388 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	NUDT1	P36639	197 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	GNPDA1	P46926	289 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	RABIF	P47224	123 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	PRLHR	P49683	370 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	SERPINB8	P50452	374 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	THOP1	P52888	689 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	KIAA1024L	P59773	190 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	IRX4	P78413	519 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	MC1R	Q01726	317 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ABR	Q12979	859 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	FZD2	Q14332	565 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	IRF3	Q14653	427 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ANGPT1	Q15389	498 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	BCL7A	Q4VC05	210 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	PYCR3	Q53H96	274 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM198	Q66K66	360 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ISCA2	Q86U28	154 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	AMZ2	Q86W34	360 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CD200R1	Q8TD46	325 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		4.2	□□□□□ -1.74

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