RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560834.1

CTDSPL2-210, Transcript of CTD small phosphatase like 2, humanhuman

TSL 4

Gene CTDSPL2, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2-210ENST00000560834 MIPOL1Q8TD10 442 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 CMTM5Q96DZ9 223 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 NEURL3Q96EH8 262 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 GAL3ST4Q96RP7 486 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 LMF1Q96S06 567 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 LHPPQ9H008 270 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 ING2Q9H160 280 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 C3orf14Q9HBI5 128 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 EQTNQ9NQ60 294 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 BCAP29Q9UHQ4 241 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 TAGLN3Q9UI15 199 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 GMEB1Q9Y692 573 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 DOCK10Q96BY6 2186 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 FRG2CA6NGY1 282 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 A6NHS1 94 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 ZFAND5O76080 213 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 NKX2-2O95096 273 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 UNC5CO95185 931 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 ANP32DO95626 131 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 CT45A8P0DMV1 189 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 CT45A9P0DMV2 189 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 ICAM2P13598 275 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 ITGA3P26006 1051 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 MAN2A2P49641 1150 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 PRKAG1P54619 331 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 CORO7P57737 925 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 MTPNP58546 118 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 FUT5Q11128 374 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 STX5Q13190 355 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 RAPSNQ13702 412 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 MYBPC3Q14896 1274 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 DUSP5Q16690 384 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 RUNDC3AQ59EK9 446 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 FCRLBQ6BAA4 426 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 ZNF621Q6ZSS3 439 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 C6orf120Q7Z4R8 191 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 RNF130Q86XS8 419 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 SIRT6Q8N6T7 355 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 TRIML2Q8N7C3 387 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 CDRT4Q8N9R6 151 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 C17orf47Q8NEP4 570 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 OR52N2Q8NGI0 321 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 OR5D16Q8NGK9 328 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 ROPN1LQ96C74 230 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 LRRC58Q96CX6 371 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 C16orf58Q96GQ5 468 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 FRMD6Q96NE9 622 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 ANKRD27Q96NW4 1050 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 OR7D2Q96RA2 312 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 CGREF1Q99674 301 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 PRORYQ9H606 182 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 GPR83Q9NYM4 423 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 MYOTQ9UBF9 498 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 PRODH2Q9UF12 536 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 PCDHGB4Q9UN71 923 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 CFL2Q9Y281 166 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 MGAQ8IWI9 3026 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 MED13Q9UHV7 2174 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 CHD8Q9HCK8 2581 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 CCT8L1PA6NM43 557 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 CLIC1O00299 241 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 WWP2O00308 870 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 HMGN4O00479 90 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 AIM2O14862 343 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL2-210ENST00000560834 TO15178 435 aa6.49□□□□□ -1.37
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