RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	DECR1	Q16698	335 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	GPAT3	Q53EU6	434 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	COX20	Q5RI15	118 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	SERPINA11	Q86U17	422 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	OR2T12	Q8NG77	320 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	CDS1	Q92903	461 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	TP53INP1	Q96A56	240 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	VSTM2L	Q96N03	204 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	BTBD9	Q96Q07	612 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	THTPA	Q9BU02	230 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	LHPP	Q9H008	270 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	PIF1	Q9H611	641 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	CMTM6	Q9NX76	183 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	GIN1	Q9NXP7	522 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	CALML5	Q9NZT1	146 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	CBLC	Q9ULV8	474 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	GMEB1	Q9Y692	573 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	ACACA	Q13085	2346 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	WWP2	O00308	870 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	HMGN4	O00479	90 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	NME4	O00746	187 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	SLC28A2	O43868	658 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	HS6ST1	O60243	411 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	NKX2-2	O95096	273 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	DRD5	P21918	477 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	PGM1	P36871	562 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	CASR	P41180	1078 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	CRISP3	P54108	245 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	CORO7	P57737	925 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	PSG6	Q00889	435 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	LIPE	Q05469	1076 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	RBBP4	Q09028	425 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	CHAF1B	Q13112	559 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	DUSP5	Q16690	384 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	MEP1A	Q16819	746 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	SPATS1	Q496A3	300 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	DCST2	Q5T1A1	773 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	PROSER1	Q86XN7	944 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	SLC34A3	Q8N130	599 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	GALNT16	Q8N428	558 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	RAB8B	Q92930	207 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	BTBD2	Q9BX70	525 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	ING2	Q9H160	280 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	LIPT1	Q9Y234	373 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	MED13	Q9UHV7	2174 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		11	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658		A8MVJ9	347 aa		11	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	MASP2	O00187	686 aa		11	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	ITGA10	O75578	1167 aa		11	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	REM1	O75628	298 aa		11	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	CIB2	O75838	187 aa		11	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	PDE9A	O76083	593 aa		11	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	ARAF	P10398	606 aa		11	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	SOX11	P35716	441 aa		11	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	SSR4	P51571	173 aa		11	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	MVD	P53602	400 aa		11	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	TLE3	Q04726	772 aa		11	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658		Q0VFX4	171 aa		11	□□□□□ -0.65
DDB1-223	ENST00000543658	SCARB2	Q14108	478 aa		11	□□□□□ -0.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms