RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504431.1

UBE2B-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 235 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-204ENST00000504431 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 ACTL8Q9H568 366 aa6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 OPTCQ9UBM4 332 aa6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 CTSFQ9UBX1 484 aa6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 RNF11Q9Y3C5 154 aa6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 KLK4Q9Y5K2 254 aa6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.98□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 A0A1B0GX78 115 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 TRBC2A0A5B9 178 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 LINC01548A6NM66 108 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 SYCE1LA8MT33 242 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 A8MT66 165 aa6.97□□□□□ -1.29
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UBE2B-204ENST00000504431 OR7A17O14581 309 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 DSCR3O14972 297 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 KLK8O60259 260 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 SMIM24O75264 130 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 CDH16O75309 829 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 JRKO75564 520 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 GNAZP19086 355 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 OTX2P32243 289 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 TMPRSS3P57727 454 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 TUBA4AP68366 448 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 DCDP81605 110 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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UBE2B-204ENST00000504431 IRF8Q02556 426 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 CHAF1BQ13112 559 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 GTF2H2Q13888 395 aa6.97□□□□□ -1.29
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UBE2B-204ENST00000504431 KRT71Q3SY84 523 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 DEFB134Q4QY38 66 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 UNC50Q53HI1 259 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 SGO1Q5FBB7 561 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 TCTE1Q5JU00 501 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 ATG9BQ674R7 924 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 FAAH2Q6GMR7 532 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 CYB5D1Q6P9G0 228 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 COX15Q7KZN9 410 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 TCAIMQ8N3R3 496 aa6.97□□□□□ -1.29
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UBE2B-204ENST00000504431 CCDC63Q8NA47 563 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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UBE2B-204ENST00000504431 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 TM4SF19Q96DZ7 209 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 AIF1LQ9BQI0 150 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa6.97□□□□□ -1.29
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UBE2B-204ENST00000504431 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 CDCP1Q9H5V8 836 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 PRORYQ9H606 182 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 PELI2Q9HAT8 420 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 HCN3Q9P1Z3 774 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 ANKMY1Q9P2S6 941 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 SLC17A7Q9P2U7 560 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 FETUBQ9UGM5 382 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 MED13Q9UHV7 2174 aa6.97□□□□□ -1.29
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UBE2B-204ENST00000504431 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 LAMA5O15230 3695 aa6.96□□□□□ -1.29
UBE2B-204ENST00000504431 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 LRRC3CA6NJW4 275 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 G3V2L1 256 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 K7ENP7 123 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 RTCAO00442 366 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 COPEO14579 308 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 ZZEF1O43149 2961 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 RDH16O75452 317 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 CREG1O75629 220 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 SUPT7LO94864 414 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 HBQ1P09105 142 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 HRH2P25021 359 aa6.96□□□□□ -1.3
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