RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 SERHLQ9NQF3 203 aa25.33■■□□□ 1.65
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HOXB3-211ENST00000490677 PNLIPRP2P54317 469 aa25.28■■□□□ 1.64
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HOXB3-211ENST00000490677 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
HOXB3-211ENST00000490677 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
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HOXB3-211ENST00000490677 FCRL1Q96LA6 429 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXB3-211ENST00000490677 TRIB1Q96RU8 372 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXB3-211ENST00000490677 CALHM2Q9HA72 323 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXB3-211ENST00000490677 TAS2R9Q9NYW1 312 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXB3-211ENST00000490677 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
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