RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486812.5

PRDM15-212, Transcript of PR/SET domain 15, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM15, Length 7,072 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15-212ENST00000486812 KCMF1Q9P0J7 381 aa9.86□□□□□ -0.83
PRDM15-212ENST00000486812 TRAV18A0A075B6X5 111 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRDM15-212ENST00000486812 FZD7O75084 574 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRDM15-212ENST00000486812 PBX2P40425 430 aa9.86□□□□□ -0.83
PRDM15-212ENST00000486812 TAS2R19P59542 299 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRDM15-212ENST00000486812 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PRDM15-212ENST00000486812 DNM1P34Q6PK57 102 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRDM15-212ENST00000486812 COLEC11Q9BWP8 271 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRDM15-212ENST00000486812 OR2A25A4D2G3 310 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRDM15-212ENST00000486812 HSD17B2P37059 387 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRDM15-212ENST00000486812 SYNPRQ8TBG9 265 aa9.85□□□□□ -0.83
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PRDM15-212ENST00000486812 SLC23A1Q9UHI7 598 aa9.85□□□□□ -0.83
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PRDM15-212ENST00000486812 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PRDM15-212ENST00000486812 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
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PRDM15-212ENST00000486812 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PRDM15-212ENST00000486812 SLC25A31Q9H0C2 315 aa9.85□□□□□ -0.83
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PRDM15-212ENST00000486812 HYKKA2RU49 373 aa9.85□□□□□ -0.83
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PRDM15-212ENST00000486812 THAP4Q8WY91 577 aa9.85□□□□□ -0.83
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PRDM15-212ENST00000486812 RXFP3Q9NSD7 469 aa9.85□□□□□ -0.83
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PRDM15-212ENST00000486812 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa9.85□□□□□ -0.83
PRDM15-212ENST00000486812 GAB2Q9UQC2 676 aa9.85□□□□□ -0.83
PRDM15-212ENST00000486812 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PRDM15-212ENST00000486812 AOC2O75106 756 aa9.85□□□□□ -0.83
PRDM15-212ENST00000486812 FBXO24O75426 580 aa9.85□□□□□ -0.83
PRDM15-212ENST00000486812 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PRDM15-212ENST00000486812 RAB5AP20339 215 aa9.85□□□□□ -0.83
PRDM15-212ENST00000486812 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PRDM15-212ENST00000486812 GLB1L2Q8IW92 636 aa9.85□□□□□ -0.83
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